zbio.net - main page Zbio.net > Calculations > Sequence tools > Six-frame translation Rambler's Top100  Russian version
MAIN PAGE · PROJECT · PROTOCOLS · PROGRAMS · LITERATURE · WEB · COMPANIES · MARKETPLACE · CLASSIFIED · FORUMS ·
Helicon · InterLabService · Dia-m · Evrogen · Syntol · Bioline · BioVitrum · Sartorius · Khimexpert · SibEnzyme · Techno Plastic Products · Bialexa · FizLabPribor · Genotek · ATG Service Gene · Beagle · SkyGen · Biogen-Analitika · Sigma-Aldrich      

Six-Frame Translation

 
       Name (not necessary):  
       Nucleotide sequence without name:
    (case insensitive, all letters except agctuswrymkhbdvn are disregarded)


       

       Nucleotide sequence:
       Output: nucleotides in one line;
       display the initial sequence;
       display complementary sequence in 5' --> 3' direction;

       Translation:
       Output: aminoacids in one line, code:  
       Frame number:
        +1;     +2;     +3;     all
        -1;     -2;     -3;    

       Alignment:
       align amino acids sequences relative to nucleic acid.


    This program translate nucleic acid sequence. Rare codons may be displayed with "Search of rare codons in nucleotide sequence".

    For manipulations with nucleic acid sequence (reverse, reverse/complement, double stranded) it is possible to use Sequence Utilities program.

    Standard symbols for polymorph nucleotides:

    Sg,CHA,C,T
    WA,TBC,g,T
    RA,gDA,g,T
    YC,TVA,C,g
    MA,CNA,g,C,T
    Kg,T  


Zbio.net: http://zbio.net
e-mail: editor@zbio.net
seen: 87351

    Supplement





       


See also:
/web-links/
Last modification: 24/02/06

MAIN PAGE · PROJECT · PROTOCOLS · PROGRAMS · LITERATURE · WEB · COMPANIES · MARKETPLACE · CLASSIFIED · FORUMS ·
Helicon · InterLabService · Dia-m · Evrogen · Syntol · Bioline · BioVitrum · Sartorius · Khimexpert · SibEnzyme · Techno Plastic Products · Bialexa · FizLabPribor · Genotek · ATG Service Gene · Beagle · SkyGen · Biogen-Analitika · Sigma-Aldrich      

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  PlastMarket - продажа комплектующих для производства окон в Украине  ·  портал про стволовые клетки stemcellrussia.com  · 
--- сервер арендован в компании euhoster.ru, Финляндия, г.Хельсинки ---
 ·  Выбрать и купить bluetooth гарнитуру в интернет-магазине Сотмаркет  ·  Купить аксессуары для ноутбуков и нетбуков оптом в интернет-магазине Либерти  ·  газовые генераторы
--- администрирование сервера: Intervipnet ---
 ·  безоперационная ринопластика от fantasticnos ·  естественное увеличение груди биоимплантами ·  запчасти для иномарок  · 

zbio.net  ·  editor@zbio.net  ·  advertizing

molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов   Rambler