zbio.net - main page Zbio.net > Calculations > Sequence tools > Six-frame translation Rambler's Top100  Russian version
MAIN PAGE · PROJECT · PROTOCOLS · PROGRAMS · LITERATURE · WEB · COMPANIES · MARKETPLACE · CLASSIFIED · FORUMS ·

Six-Frame Translation

 
       Name (not necessary):  
       Nucleotide sequence without name:
    (case insensitive, all letters except agctuswrymkhbdvn are disregarded)


       

       Nucleotide sequence:
       Output: nucleotides in one line;
       display the initial sequence;
       display complementary sequence in 5' --> 3' direction;

       Translation:
       Output: aminoacids in one line, code:  
       Frame number:
        +1;     +2;     +3;     all
        -1;     -2;     -3;    


       Alignment:
       align amino acids sequences relative to nucleic acid.


    This program translate nucleic acid sequence. Rare codons may be displayed with "Search of rare codons in nucleotide sequence".

    For manipulations with nucleic acid sequence (reverse, reverse/complement, double stranded) it is possible to use Sequence Utilities program.

    Standard symbols for polymorph nucleotides:

    Sg,CHA,C,T
    WA,TBC,g,T
    RA,gDA,g,T
    YC,TVA,C,g
    MA,CNA,g,C,T
    Kg,T  


Zbio.net: http://zbio.net
e-mail: editor@zbio.net
seen: 65333

    Supplement





       


See also:
/web-links/
Last modification: 24/02/06

MAIN PAGE · PROJECT · PROTOCOLS · PROGRAMS · LITERATURE · WEB · COMPANIES · MARKETPLACE · CLASSIFIED · FORUMS ·

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  PlastMarket - продажа комплектующих для производства окон в Украине  · 
--- сервер арендован в компании euhoster.ru, Финляндия, г.Хельсинки ---
 ·  Slando - объявления о работе в Киеве и Киевской области  ·  Купить bluetooth гарнитуру на SotMarket.ru  ·  Купить аксессуары для ноутбуков и нетбуков оптом в интернет-магазине Либерти
--- администрирование сервера: Intervipnet ---
 ·  Сландо - работа в Москве: огромная база вакансий и резюме  ·  отличный выбор ванны чугунные с доставкой  ·  недорогие межкомнатные двери в интернет-магазине  · 

zbio.net  ·  editor@zbio.net  ·  advertizing

molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов   Rambler