molbiol.ru -> НЦИТ УниПро <span title='число переходов'>/ 20 /</span>

> Все форумы > Тематические форумы > Фирмы

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* НЦИТ УниПро / 20 / -- Новосибирск --
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

Yulia D

15.08.2006 14:16

URL #1

Компания УниПро разрабатывает оригинальные программные продукты для биоинформатики, и интегрирует в них известные алгоритмы и сервисы. Мы открыты для сотрудничества с академическими, образовательными и коммерческими учреждениями (разработка специализированного и учебного ПО, расширения к существующим пакетам, адаптация алгоритмов для разных платформ, мультипроцессорных и многопоточных вычислений).

UGENE – свободно распространяемое ПО для анализа генетических и белковых последовательностей, дающее широкие возможности визуализации, анализа, аннотирования, индивидуальной настройки. Обеспечена мультиплатформенная поддержка. Оптимизация алгоритмов для параллельных вычислений и многопоточной работы позволяет эффективно использовать различные вычислительные ресурсы (multicore CPUs, GPU blocks, HPC clusters, grids).

Основные функции:
* Просмотр и анализ аннотированных геномных или белковых последовательностей.
* Визуализация хроматограмм.
* Поиск ORFs (открытых рамок считывания)
* Интеграция с поисковыми запросами к базам NCBI
* Множественное выравнивание с адаптированными версиями алгоритма MUSCLE
* Интерфейс для поиска HMM профилей в адаптированном пакете HMMER
* 3D-визуализатор макромолекул для файлов в формате PDB
* Графический дизайнер для построения схем обработки данных (computational workflows)
* Поиск транскрипционных факторов связывания (TFBS) в ДНК

UniPro Genome Browser
– браузер для манипуляций с одной генетической последовательностью вплоть до размера генома с подробной визуализацией, масштабированием, поиском, и аннотированием. Набор плагинов делает доступными различные алгоритмы анализа.

UniPro DPView – инструмент для поиска гомологий путем сравнения нуклеотидных или пептидных последовательностей и создания выравниваний. Фильтрация и масштабируемость существенно ускоряют время вычислений.

/ Фирмы, #113339 /

Россия, 630090, Новосибирск, пр-кт ак. Лаврентьева, 6/1

Тел.: +7 (383) 332-60-61

Факс: +7 (383) 330-29-60

E-mail: marketing@unipro.ru, ugene@unipro.ru

Веб-адрес: http://ugene.unipro.ru

Специализация: Анализ последовательностей, Программы для мол. клонирования и ПЦР, Программы для Автоматизации и Анализа данных, Другое програмное обеспечение

География деятельности: по всему миру

Сообщение было отредактировано Redactor - 16.10.2012 04:40

V Denis

16.08.2006 09:53

URL #2

Есть хорошая альтернатива - межинститутский ЦКП: секвенирование ДНК. http://sequest.niboch.nsc.ru/
Но альтернативы это здорово! Удачи вам!

vrida2
Постоянный участник

02.09.2020 14:56

URL #3

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.