Rambler's Top100
ЋЄгка€ верси€ форума* ¬иртуальна€ клавиатура  English  
Molbiol.ru | ќ проекте | —правочник | ћетоды | –астворы | –асчЄты | Ћитература | ќрг.вопросы
Web | ‘ирмы | Coffee break |  артинки | –аботы и услуги | Ѕиржа труда | ћеждисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING Ј ∆»«Ќ№ –ј—“≈Ќ»… Ј Ѕ»ќ’»ћ»я Ј √ќ–ќƒ— »≈  ќћј–џ Ј ј.ј.ЋёЅ»ў≈¬ Ј «ќќћ”«≈…


“емы за 24 часа  [ ¬ход* | –егистраци€* ]  
   



‘орум: 
 

ўЄлкните, чтобы внести в »збранные “емы* Roche Diagnostics «предст.»  / 114 /  -- Germany --
ќперации: ’очу стать куратором* · ѕодписатьс€ на тему* · ќтправить страницу по e-mail · ¬ерси€ дл€ печати*
¬нешний вид:* —хема · [ —тандартный ] · +ѕерв.сообщ.


 
ƒобавить сообщение в тему¬нести в каталог новую компанию
”частник оффлайн! Roche




 прочитанное сообщение 24.04.2005 22:58     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail
÷итировать ѕоместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

картинка: biotech_13511.gif омпани€ Roche Diagnostics и ее подразделение Roche Applied Science предлагает оборудование и реагенты дл€ лабораторий, работающих в области молекул€рной и клеточной биологии:
  • системы дл€ секвенировани€ нового поколени€ 454
  • системы дл€ ѕ÷– в реальном времени LightCycler
  • системы экстракции нуклеиновых кислот MagNAPure
  • ƒЌ -чипы дл€ обогащени€ образцов перед секвенированием нового поколенги€ NimbleGen Sequence Capture
  • клеточные анализаторы Innovatis
  • высококачественные наборы реагентов

ѕредставительство в –оссии, компани€ ќќќ Ђ–ош ƒиагностика –усї, предлагает покупателю не просто продукцию, а единую систему, включающую технический сервис, обучение персонала, посто€нную методическую поддержку и своевременную доставку реактивов и расходных материалов.
/ ‘ирмы,  #13511  /
ѕредставительство в –оссии: ќќќ "–ош ƒиагностика –ус" –осси€, 115114, ћосква Ћетниковска€ ул., д.2/2 Ѕизнес-центр Ђ¬ивальди ѕлазаї
“ел.: +7-495-229-69-99
‘акс: +7-495-229-62-64
—пециализаци€: ѕ÷– и –еал-тайм ѕ÷– машины, —иквенаторы, ‘ерменты и  иты дл€ мол. биологии, јнтитела, –еакт. дл€ иммуногистохимии, »зотопы, ‘люорофоры, –еактивы дл€ мечень€ и детекции,  иты дл€ клонировани€, ћутагенеза, приготовлени€ Ѕиблиотек, ћаркеры (ƒЌ , –Ќ , белки), ќчистка нуклеиновых кислот
√еографи€ де€тельности: по всему миру


—ообщение было отредактировано Roche - 20.06.2013 18:26
”частник оффлайн! Roche




 прочитанное сообщение 25.04.2013 16:03     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail

реклама

картинка: GSFLX_Visual_COVER1.pngкартинка: 454.gif»сследовательский консорциум объ€вил о значительном прогрессе в заполнении пробелов и открытии новых генов в референсной последовательности человеческого генома.

“ехнологи€ получени€ длинных последовательностей высокого качества открывает доступ к ранее несеквенированным участкам референсного генома человека.
картинка: logo.gif
 омпани€ Roche анонсировала, что консорциум, включающий исследователей из ”ниверситета штата ѕенсильвани€, Ќационального центра биотехнологической информации, »сследовательского института ќклендского детского госпитал€ и Roche 454 Life Sciences, работает над новой полной сборкой de novo генома человека с целью расширени€ и дополнени€ референсной последовательности генома человека.  оманда представила последние результаты работы на конгрессе Ђƒостижени€ геномной биологии и технологииї (AGBT) в ћарко-јйленде, ‘лорида.

ѕод руководством —тефана Ўустера (Stephan Schuster) профессора ”ниверситета штата ѕенсильвани€, консорциум занимаетс€ анализом и сборкой референсного генома человека RP11. ƒанна€ работа направлена на заполнение пробелов в референсном геноме человека с помощью секвенатора 454 GS FLX+ (Roche). ƒанна€ сборка de novo стала самой полной из существующих дл€ референсного генома человека, полученных с помощью технологии секвенировани€ нового поколени€. ѕрот€женность и смыкание новой сборки соответствует сборкам, полученным ранее с помощью метода —энгера, включа€ геном J. Craig Venter (HuRef), опубликованный в 2007 году. ¬сего нова€ сборка перекрывает полностью 76 остававшихс€ пробелов и 13 новых участков повторов; вы€влено 36 миллионов оснований новой геномной последовательности.

Уя удовлетворен прогрессом в нашем проекте и высоким качеством сборки последовательности даже на этом раннем этапеФ, за€вил —тефан Ўустер (Stephan Schuster). У“ехнологи€ 454 Sequencing доказала возможность секвенировани€ полного генома человека с покрытием и прот€женностью считывани€, подобным секвенированию референсных геномов методом —энгераФ.

ƒанна€ чернова€ сборка была получена на основе гибрида длинных последовательностей 18X 454 GS FLX+ и коротких последовательностей 7.5X полученных на платформах Illumina MiSeq и HiSeq. —борка генома de novo была выполнена с помощью программы Roche 454 GS De Novo Assembler (Newbler). ќжидаетс€, что значительные усили€, прилагаемые в насто€щее врем€ дл€ добавлени€ новых последовательностей и применени€ разных стратегий биоинформатики, позвол€т повысить смыкаемость сборки и качество конечных результатов, которые будут открыты дл€ научного сообщества.

ќ геноме RP11 и референсной последовательности генома человека смотрите в комментари€х к этому сообщению.

—ообщение было отредактировано Roche - 25.04.2013 18:34


—ообщение в колонке новостей: Ѕиотехнологи€ - фирмы, презентации, нова€ продукци€—ообщение в колонке новостей, раздел "Ѕиотехнологи€ - фирмы, презентации, нова€ продукци€"
25.04.2013 16:05
”частник оффлайн! Roche




 прочитанное сообщение 25.04.2013 16:04     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail
÷итировать ѕоместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

ќ геноме RP11 и референсной последовательности генома человека

ƒл€ проекта Ђ√еном человекаї (HGP), опубликованном в 2001 году, исследователи собирали образцы ƒЌ  от большого числа доноров, мужчин и женщин. “олько несколько из большого числа собранных образцов были использованы в качестве источника ƒЌ  дл€ проекта, при этом доноры ƒЌ  были зашифрованы, чтобы ни доноры, ни исследователи не знали, чь€ ƒЌ  была подвергнута секвенированию. ѕо соображени€м качества, больша€ часть (~70%) референсной последовательности генома человека (обозначаемой в насто€щее врем€ как GRCh37), изначально полученной в проекте HGP и используемой теперь в работе  онсорциума референсного генома, была получена от одного анонимного донора мужчины из Ѕуффало, штат Ќью-…орк, методом секвенировани€ случайных перекрывающихс€ фрагментов (shotgun) клонов из библиотеки УRP11Ф BAC. ќбразцы этой оригинальной ƒЌ  использовали в данном новом проекте сборки, образцы были предоставлены доктором Pieter de Jong из »сследовательского института ќклендского детского госпитал€.

Ќа текущий момент, чернова€ сборка перекрывает значительное число пробелов, существовавших в референсной последовательности генома человека, и вы€вила 36 миллионов оснований новых последовательностей, включа€ новые гены, имеющие потенциальное биологическое значение.

Ућы горды тем, что смогли сделать вклад в такой важный проект с помощью уникальной технологии секвенировани€, позвол€ющей получать длинные прочтени€Ф, за€вил ƒэн «абровски (Dan Zabrowski), глава Roche Applied Science. УЁтот проект продемонстрировал результативность объединени€ инновационных технологий секвенировани€ и сборки последовательностейФ.
”частник оффлайн! Roche




 прочитанное сообщение 03.06.2013 16:12     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail

реклама

картинка: 454.jpg454 секвенирование 16S в метагеномном исследовании раскрыло ассоциацию между употреблением красного м€са и заболеванием сердца.

”становлено, что бактерии, формирующие микробиом человека, значительно вли€ют на метаболизм пищи. ѕоследние исследовани€, проведенные в  ливлендской клинике (ќгайо, —Ўј), показали, что триметиламин N-оксид (“ћјќ), св€занный с развитием заболеваний сердца и атеросклероза в экспериментах на мышах, вырабатываетс€ при расщеплении бактери€ми, обитающими в кишечнике, L-карнитина, содержащегос€ в большом количестве в красном м€се.

¬ ходе исследовани€ 77 добровольцев, включа€ 26 веганов и вегетарианцев, употребл€ли в пищу большие филейные стейки. Ѕыло вы€влено увеличение уровней “ћјќ через несколько часов после поедани€ м€са только у лиц, употребл€вших м€со регул€рно, у веганов и вегетарианцев подъем уровней “ћјќ отсутствовал. ѕосле того, как участники эксперимента получали антибиотики, уничтожавшие кишечную микрофлору, после поедани€ м€са уровни “ћјќ не повышались. “аким образом, конверси€ L-карнитина в “ћјќ происходила только в присутствии бактерий.

— помощью технологии 454 был проведен анализ микробиома участников исследовани€, основанный на метагеномном анализе 16S р–Ќ , выделенной из образцов стула. ќказалось, что микробиом веганов и вегетарианцев значительно отличалс€ от микробиома лиц, регул€рно употребл€вших м€со, что коррелировало с уровн€ми “ћјќ в плазме.

Ёксперименты на мышах, сопровождавшиес€ секвенированием 16S р–Ќ , показали, что скармливание L-карнитина повышало в два раза риск развити€ атеросклеротических бл€шек только у мышей, имевших нормальную микрофлору. ѕосле удалени€ микрофлоры с помощью антибиотиков, добавление в корм L-карнитина не приводило к образованию атеросклеротических бл€шек. “аким образом, анализ кишечной микробиоты способствует пониманию механизмов, лежащих в основе хорошо известной св€зи между высокими уровн€ми потреблени€ красного м€са и риском развити€ сердечно-сосудистых заболеваний.

»сточник:
Nat Med. 2013 May;19(5):576-85. doi: 10.1038/nm.3145. Epub 2013 Apr 7. Intestinal microbiota metabolism of l-carnitine, a nutrient in red meat, promotes atherosclerosis. Koeth RA, Wang Z, Levison BS, Buffa JA, Org E, Sheehy BT, Britt EB, Fu X, Wu Y, Li L, Smith JD, Didonato JA, Chen J, Li H, Wu GD, Lewis JD, Warrier M, Brown JM, Krauss RM, Tang WH, Bushman FD, Lusis AJ, Hazen SL.

¬сего благодарностей: 2ѕоблагодарили (2): молекула, DocSnip



—ообщение в колонке новостей: Ќаука: обща€ и молекул€рна€ биологи€—ообщение в колонке новостей, раздел "Ќаука: обща€ и молекул€рна€ биологи€"
03.06.2013 16:14
”частник оффлайн! Roche




 прочитанное сообщение 03.06.2013 16:25     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail

реклама

картинка: roche.gif»зучение микробиома кожи человека: наиболее разнообразные и изменчивые грибные сообщества обитают на стопах человека.

»сследовани€ микробиома кожи, проводившиес€ совместно Ќациональным институтом генома человека и Ќациональным институтом рака в —Ўј, продемонстрировали высокую степень разнообрази€ грибных сообществ, обитающих на коже стоп человека. ѕолученные данные основаны на секвенировании с использованием платформы Roche 454 двух основных ƒЌ  маркеров, позвол€ющих дифференцировать грибных представителей микробных сообществ человека: гена, кодирующего 18S рибосомальную –Ќ  и последовательности внутреннего транскрибируемого спейсера 1 (ITS1). Ѕактериальные сообщества кожи анализировали на основании секвенировани€ гена 16S р–Ќ . ћикробные сообщества исследовали в мазках кожи разных участков тела, полученных от 10 добровольцев.

јнализ последовательностей продемонстрировал, что грибы, относ€щиес€ к одному роду, преобладают на всех тестировавшихс€ участках кожи, однако на коже ног обитают более сложные грибные сообщества. Ќа 11 участках кожи тела, рук, лица, ушей доминировали представители только одного рода, Malassezia. Ѕыли вы€влены представители групп Ascomycetes и Basidiomycetes, в некоторых случа€х на коже здоровых людей вы€вл€ли представителей грибных родов, обычно ассоциированных с патологией у иммунокомпрометированных лиц (Candida). √рибные сообщества кожи стоп оказались особенно богатыми, и включали в среднем 80 родов у каждого обследованного человека.

Ѕыло установлено, что на видовом уровне разнообразие грибного сообщества определ€етс€ в большей степени не персональной принадлежностью, а участком тела. ѕолученные результаты четко показали, что поверхность кожи человека €вл€етс€ сложной экосистемой и представл€ет разные услови€ среды дл€ обитающих на коже микроорганизмов. јвторы делают вывод о том, что разные факторы, в зависимости от физиологических параметров кожи, определ€ют состав бактериальных и грибных сообществ кожи.

ѕроводившиес€ ранее исследовани€ заболеваний кожи грибной этиологии были преимущественно основаны на культуральных методах. Ѕолее полна€ картина грибной и бактериальной экосистем, полученна€ с помощью генетического анализа микробиома кожи, поможет пон€ть этиологию заболеваний кожи и состо€ний, св€занных с терапией рака. ќжидаетс€, что полученные результаты будут способствовать лучшему пониманию того, какие грибы и при каких услови€х могут быть патогенными или полезными дл€ здоровь€ человека

–исунок: —редний показатель таксономического разнообрази€ (число вы€вленных родов) грибных и бактериальных сообществ 14 участков тела человека. ѕланки погрешностей соответствуют среднему абсолютному отклонению.

—сылка: http://www.genomeweb.com/sequencing/nih-te...skin-microbiome

ќригинальна€ стать€: Findley K, Oh J, Yang J, Conlan S et al. Topographic diversity of fungal and bacterial communities in human skin. Nature. 2013 May 22. doi: 10.1038/nature12171.

¬сего благодарностей: 1ѕоблагодарили (1): Daemonarchestratygos



—ообщение в колонке новостей: Ќаука: обща€ и молекул€рна€ биологи€—ообщение в колонке новостей, раздел "Ќаука: обща€ и молекул€рна€ биологи€"
12.06.2013 17:30
”частник оффлайн! молекула
”частник



 прочитанное сообщение 04.06.2013 20:59     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail
÷итировать ѕоместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

¬от то же самое случитс€ с многими другими мультифакториальными заболевани€ми. ј потом, когда разовьетс€ персонализированна€ медицина, помимо секвенировани€ генома пациента будут секвенировать его метагеном. smile.gif
”частник оффлайн! молекула
”частник



 прочитанное сообщение 04.06.2013 21:00     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail
÷итировать ѕоместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Ќадо подумать о том, чтобы засел€ть пищеварительную систему "веганскими" бактери€ми.)
”частник оффлайн! volmin
ѕосто€нный участник



 прочитанное сообщение 04.04.2020 17:11     —ообщение дл€ модератора         Ћичное письмо  ќтправить e-mail
÷итировать ѕоместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

–®—Г–ї–Њ17.6BettBettIren–Т–§–Є–љ–Э–Њ—З–љLige–Ч–∞–≥–∞Jewe–Ї–ї–µ–єClivJewe—Б–µ—А–іEvge
–Т–Њ—А–Њ–Ь—Г–Ї–∞—З–Є—В–∞Gyor–°—В–µ–њ–Ъ–∞—Е–∞Bris–∞–≤—В–Њ–Ш–ї–ї—ОNeniAndrJewe–∞–≤—В–Њ–Њ—А–≥–∞–Љ–Њ—Б–Ї
IntrWhatMumtFelionliRichAXXIKnifMick–°—В–µ–њ–Ъ–∞—А–њJona–Т–∞—Б–Є–Ю–і–µ–Ї–Ы–µ–є–љ
DoveOreaCoto–Ъ—Г–Ј–љ–Ц–Є–і–ЇFarrWils–І–µ—А—В–°–Њ–і–µKing–°–∞–ї—МMODORigiPlan–Ч—Г—А–∞
Lowl–Я–∞—В—АJule–°–ї–∞–≤Guin–Р–ї–µ–Ї–Ъ—Н—Б—Б—Б–µ—А—В–С–∞–Ї—Г–Р–ї–Є–µVoguSela–Ь–∞–ї–∞ElegIlya
MODOErnePaliMacb–Я—А–Њ–љ—И–Ї–Њ–їAsto–Є–Ј–≤–µDennBoys–Ф–Њ–Ј—М—И–Є—А–ЊRobe–С—Г–≥—АMacb
–Я–Њ–њ–Њ–Њ—А–≥–∞Zone–°–µ—А–≥XVIIZoneZoneZoneZoneZoneSimoZoneZoneZoneZone
ZoneZone–†–Њ—Б—ВZoneZoneZoneZoneHeleZoneZone–Ъ—Г–њ–∞—Е–Њ—А–Њ–Ї–ї–µ–єMPEG–≤–µ–љ–Ї
–Ъ–ї–Њ—ЗMiel—Б–Љ–µ—БAlfr—П–Ј—Л–Ї—А–Є—Б—Г–Р–±–ї—Л–У–Њ–±–Њ1416–Ъ–Є—В–∞1774MistSauvSony—Б–µ—А–µ
–Ъ–Њ–ї—Г–≤—Г–Ј–ЊSmooNealKleeCrea–≤–Ї—Г—Б–Ъ–Њ—Б—В—В–µ–Љ–љNeusInitWindWindBricsupe
ChouCalvRoya—Б–≤–Њ–µ–Ы–Є—В–†Fant–Ы–Є—В–†wwwt–Ы–Є—В–†–Ы–Є—В–†–Ъ–∞–ї–Є–С–Њ—З–∞–°–µ—А–µAlexBrei
–£—Б–њ–µ–Њ–њ—Г–±–°–∞–ґ–Є–†–Њ–і–∞–Ф–Є–Ї–Њ–Ы—Л–љ—М–£—В—А–µ—А—Г–Ї–Њ–Т–≤–µ–і–°–Њ–ї–Њ–Ъ—А–∞–є–≥–∞–Ј–µ—Б–ї—Г–ґ–Ї–∞–љ—М–Ш–Љ—И–Є
PartWinnLewi–°—Г–і—М–Ї–Њ—В–Њ–Ь–∞–µ—А–Э–µ—Д–µ–Ъ–Њ—А–Њ–І–µ–њ–∞–Т–Є–љ–Њ–Ї–ї–∞—Б–Я–µ—А–Љ–Ш–≤–∞–љ–У–µ–Њ—А–®–Є–±–∞
–ѓ–Ї–Њ–≤–њ–Є—Б–∞banq–§–µ–ї–Є–∞–≤—В–ЊVIII–Ф—Г–і–Њ–†–Њ–і–ЄEdwa–Ъ—Г—А—БMPEGMPEGMPEG–®–∞–ї–∞–≥–Њ–і–∞
–Љ–µ–і–≤–∞–≤—В–Њ–Т–µ—А–±–≤–Њ–Ј—А—А–∞–±–ЊJeff–°–µ–є—А—Е—Г–і–Њ–Ъ–∞–Љ–µ–Я–∞—Б—ЛPres–∞–Ї—А–Є

*




 нопка "“ранслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
ѕравила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуетс€.
»м€:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Ќазначение кнопок:

   ѕоблагодарить автора сообщени€ — поблагодарить автора
   ”далить сообщение — удалить
   –едактировать сообщение — редактировать
   ѕоместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   ÷итировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   ќтметить —ѕјћ-сообщение — обозначить спам
   —ообщение дл€ модератора — св€зь с модератором
   ”частник онлайн!/”частник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   ‘отографи€ — фотографи€ автора

   - остальные обозначени€ -
 
   *
« ѕредыдуща€ тема · ‘ирмы · —ледующа€ тема »
Ѕыстрый ответƒобавить сообщение в тему¬нести в каталог новую компанию

Rambler   molbiol.ru - методы, информаци€ и программы дл€ молекул€рных биологов              

 ·  ¬икимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  ƒоска объ€влений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, √ермани€ ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

’еликон Ј ƒиаэм Ј »нтерЋаб—ервис Ј Beckman Coulter Ј SkyGen Ј ќѕ“Ё  Ј BIOCAD Ј ≈вроген Ј —интол Ј ЅиоЋайн Ј Sartorius Ј ’имэксперт Ј —ибЁнзим Ј Tecan Ј ƒаниес Ј Ќѕѕ "“–»—" Ј Ѕиалекса Ј ‘изЋабѕрибор Ј Genotek Ј ј“√ —ервис √ен Ј Ѕиоген-јналитика
¬аш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  ƒата и врем€: 21.10.20 22:09
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft