Задам вопрос тут - чтобы ветки не плодить.
Есть задача - как померить концентрацию, а лучше сразу молярность очень низких концентраций РНКа. РНКи фрагментированные в диапазоне 50-200 нуклеотидов - для сайт-специфичного сиквенса РНКи (всякие PIR/CLIP).
Можем делать хорошие библиотеки от 100 пикограмм на пробирку. То есть, нужно померить концентрацию 10-20 пикограмм на мкл - всего образцы по 7-8 мкл. На измерение можем потратить 1 мкл, ну максимум 2 мкл.
Есть под рукой:
1. RiboGreen - из-за того, что образец нужно разводить в 100-200 раз - нужно от 1нг на мкл - не катит, пробовал - не лучше пункта 2.
2. Agilent BioAnalyzer - PicoChip - пишут от 50 пикограмм на мкл, но нормально меряет от 100 и то не для шмера - промах опять раз в 10 от того, что нужно.
3. qPCR - не покатит, так как не такая уж и чувствительность и РНКа для разных антител - разная - праймера не подобрать. Образцов будет много.
4. Всякие гели и простой спек - раз в 100 больше нужно материала.
Есть у кого идеи - ну и желательно, чтобы стоило меньше мульона за образец
Вполне допускаю - что задача пока нерешаемая - нет таких методов для рынка пока. Точность желательно бы +/- 30% или даже +/- 20%. РНКа самая обычная, без меток и радиоактивности.
Огромное спасибо за советы!