Полная версия страницы  English  

Непонятный рост флуоресценции в реал-тайме

lmb, 18.10.2016 19:51
Здравствуйте, уважаемые форумчане!

Подскажите, пожалуйста, что творится у нас в реал-тайме: почему у большинства образцов наблюдается такое высокое разгорание на начальных циклах амплификации?
1) Пробы точно отрицательные. 2) такая картина не постоянная, а происходит время от времени. Иногда такого разгорания не наблюдается на этой же партии олигонуклеотидов. 3) повторяется и на биораде.
Спрашивайте, если чего упустил - отвечу.

Заранее благодарю за ответы!


Картинки:
______.PNG - кликните, чтобы открыть увеличенную картинку
______.PNG — (123.65)   

Ivalex, 19.10.2016 09:54
У вас это зонды? Или чем детектируете?
Можно биорадовскую картинку?
lmb, 19.10.2016 12:43
Да, это такман. Из картинки видно, что HEX канал.
Биорадовской пока под рукой нет , поэтому и не вставил.
Noom, 19.10.2016 14:23
Можно увидеть картинку без вычета базовой линии? И без нормализации по роксу если она делалась.
lmb, 20.10.2016 12:23
нормализации по роксу не делалось


Картинки:
______2.PNG - кликните, чтобы открыть увеличенную картинку
______2.PNG — (93.05)   

lmb, 20.10.2016 19:35
MACS2 - не понял Вашего ответа, но Ротор и Биорад не требуют нормализации по роксу, это вроде как привилегии Аплайда. Рост кривых на начальных циклах - что-то не нормальное, т.к. в пробе отсутсвует матрица для отжига праймеров - это все отрицательные пробы.
lmb, 20.10.2016 20:36
10 кратных разведение нет. К ним претензий в реакции нету - работают идеально в данной системе. К+ - 50 копий в реакции.
-Ъ-, 21.10.2016 00:30
Все дело в зонде и праймерах. Сигнал на 10 цикле - миллионы копий или дикая "игра" зонда и праймеров. Девайс тут не причем.
Можете выложить последовательности?
-Ъ-, 21.10.2016 00:43
(MACS2 @ 21.10.2016 01:38)

Возможно ты энту ссылку уже выкладывал, благодарю за заботу. wink.gif
ksm, 21.10.2016 07:07
внематочный...
lmb, а на форезе что?
lmb, 21.10.2016 10:14
MACS2 теперь Вы меня не поняли: К+ на картинке - это 50 копий геном/экв.
внематочный зонды так не валит, это может быть только с сайбром/евой.
Но вроде разобрались, Ъ прав - тут дело все только в зонде - он сам дает такой же сигнал при циклировании без полимеразы в том же буфере.
Ну а с форезом - это самоубийство ставить его, если у тебя чувствительность 1 копя, как в этом случае. Проще уже тогда сайбром посмотреть.

Всем спасибо за помощь!
lmb, 21.10.2016 10:47
50 500 5000 50 000 500 000 выходят прекрасно и параллельно друг другу с шагом в 3.33 +/- лапать.
Вопрос данной темы был не в оптимизации работы системы как таковой. А том , что творилось с пробами заведомо не содержащими матрицу.
"без праймеров и трифосфатов не пробовали" - не пробовали, попробуем. Но картинка повторяется на нескольких приборах... Канал FAM - идеален.
lmb, 26.10.2016 09:56
читайте внимательно, я не писал, что пробы на воде, я писал, что они не содержат целевой участок, а самой балластной ДНК там навалом.
nigoal123, 19.05.2022 06:44
Anyone can connect บาคาร่าออนไลน์ with their audience slot xo through blogging and enjoy 11hilo you who your readers are. สล็อต the myriad benefits that 123GOAL blogging provides

organic traffic from nigoal from the first sentence.ลิงค์รับทรัพย์ search engines promotional พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง content for social media ราคา บอล and recognition from a new Hotgraph audience you haven’t tapped into yet.
guest: 123vega , 19.05.2022 10:45
For the past 15 years, India Pggame123 and China have vied 88ktc for favourable diplomatic สล็อต123 and trade relations 123bets with Sri Lanka thanks 11hilo to its strategic location in the Indian หวยปิงปอง ocean. While popular perception สล็อต123 indicated China had outpaced India, the 123VEGA recent economic and Dreamgaming political turmoil in Sri Lanka seems to ปั่นสล็อต have given India's foreign policy.
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.