Посоветуыте, стоит ли приобрести третье издание "Molecular Clononing", если уже имеется второе? Или третье деыствительно так сильно обновлено?
Кто что-нибудь знает про "Current protocols in molecular biology" (Ausubel et al.)? (не путать с их же "Short protocols in Molecular Biology") Может это лучше купить?
[Текст переведён с транслита]

subunit
Я не видел третьего издания, но думаю, что вряд ли протоколы, которые есть во втором, за десять лет перестали работать. Другое дело, что во втором издании не все есть. К третьему также прилагается подписка на их online сайт molecularcloning.com, что тоже плюс (хотя я там не мембер, не могу сказать, насколько хорошо сайт наполнен содержанием). Но без поиска по интернету все равно не обойтись. В общем, если если то, что нужно, есть во втором издании, то я бы не стал тратить 150 фунтов.
Архивная копия Current Protocols в электронном виде у меня есть. В принципе хорошая вещь, но качество сильно варьирует, покольку все главы писали разные люди. Идея была неплохая, но в результате качество неравномерное: некоторые протоколы просто супер, а некоторые так себе.
В принципе неплохо иметь в лаборатории обе книги - часто именно сравнение протоколов оттуда и оттуда помогает найти тонкие места. Сделать однозначную рекомендацию в пользу того или другого (если выбирать) я затрудняюсь.

Спасибо, что высказали свое мнение!
Мне очень нужна одна глава из "Current Protocols", наверно, слишком "нахально" было бы просить всу електроннуу версиу зеликом(?), хотя очень хотелось бы! Но может быть можно попросить хотя бы главу: Riggs P. "Expression and purification of maltose-binding protein fusions"?
[Текст переведён с транслита]

to DVKup
Если не затруднит, а сколько весит эл. версия книги? И какая история ее создания? Это я к тому, что можно ли ее попросить, или это не совсем удобно?

А нельзя ли ее выставить на сайте, чтобы каждый мог скачать?
Если нет не могли бы ее прислать на e-mail: parhitko@pochtamtm.ru или parhitko@hotbox.ru

subunit
VSK
Parhit
Current Protocols весит примерно 50 МБ, может быть и меньше, точно сказать не могу, поскольку база находится на диске, с которого инсталлируется, наверное, что-то можно выбросить, но немного, и времени на эксперименты нет. Для e-mail это многовато, а на тот сервер, на который такой объем влезет, класть не хотелось бы из legal соображений. Единственный вариант, который могу предложить - заходите в гости с пустой 700 МБ болванкой, запишу копию. На этом диске, кроме CBMB, есть еше CP in Immunology, какое-какая еще справочная литература по имммунологии, а также полезная коллекция софта, нажитого непосильным воровством , а местами даже честно приобретенного.
Так что если есть жаление - пишите на мыло.
subunit
Послал главу по мылу.

Molecular Cloning,3rd ed.(121Mb,PDF)
Current Protocols in Cell Biology(9Mb,HTML)
Lewin,GENES 7th ed.(17Mb,CHM)

и другая литература...
[ 19-07-2002: Сообщение отредактировано: Abd ]

WOW.

Да уж, "унушаить" (С)
[off]В "Другой литературе" ни одна ссылка не работает. [/off]

Часть все же работают. Подкупает масштаб. Похоже, у коллег с авторскими правами все в порядке. Кстати, как звучит по-китайски фенол/хлороформ?

Abd:
известно ли , как переводили в HTML Current Protocols? Если есть автоматический способ, я бы сделал то же самое со своими копиями Molecular Biology и Immunology. А ручками не буду, некогда.
All:
Кстати, процесс с дисками пошел. Сегодня с утра (меня не было на месте) зашел чел, оставил бумажку с адресом и пустую болванку. Сегодня ближе к вечеру сделаю копию и отпишу ему. Так что пишите письма, кому интересно.
Чтоб два раза не ездить, лучше списываться заранее, я буду делать копию на свою болванку, а потом просто меняться с вами на пустую.

Abd
НетЮ ну я натурально балдею. А сервер-то, сервер какой! Маниатис (120 МБ, 2200 страниц) скачался всего за час!

DVKup
Если файл не тянется от китайцев, его можно найти по имени через гугль или фтп-поиск. Я кое-что так нашел.

Слушайте а там и не только книги, но и куча софта, просто надо немного фантазии и можно примерно понять что и где. Названия програм то по английски...
[Текст переведён с транслита]

<blockquote><font size="1" face="Verdana, Helvetica, sans-serif">цитата:

---

Автор - DVKup:
Abd:
известно ли , как переводили в HTML Current Protocols? Если есть автоматический способ, я бы сделал то же самое со своими копиями Molecular Biology и Immunology. А ручками не буду, некогда.

---

</blockquote>
Не знаю. Спросите у китайцев
Вообще-то конвертеры наверняка существуют. Надо поискать в Инете.

Abd
Вообще-то конвертеры наверняка существуют. Надо поискать в Инете
Я не нашел .

Конверторы надо искать в сборниках типа Софтлист или Листсофт, фрисофт.ру, фриваре.ру и т.д. А еще в ХТМЛ можно сохранять Вордом 97 и старше, не говоря уже о специальных ХТМЛ редакторах.
У меня где-то зарыт конвертор в формат Windows Help - это удобнее, чем ХТМЛ, так как дает индекс и поиск по тексту. Если найду - вышлю.
[ 19-07-2002: Сообщение отредактировано: K^2 ]

K^2
конвертер откуда? Из базы Current Protocols? Загвоздка именно здесь, переконвертить HTML во что-то другое уже не проблема. Если из CP, то давайте, придется очень кстати.

Да, тут конечно проблематично...
База, конечно же, в сжатом виде.
Программист нужен толковый (и добрый).

Abd
База, конечно же, в сжатом виде.
А то! Еще и в зашифрованном - без ключа не открывается

2DVKup
А в каком собственно формате находятся ваши Molecular Biology и Imunology? Насколько я понял не в бумажном
Все ж зависит от того откуда конвертировать, и проще наверное не в ХТМЛ, а в файлы-справки - чтобы и картинки и текст были сразу в одном файле.

<blockquote><font size="1" face="Verdana, Helvetica, sans-serif">цитата:

---

Автор - DVKup:
Abd:
известно ли , как переводили в HTML Current Protocols? Если есть автоматический способ, я бы сделал то же самое со своими копиями Molecular Biology и Immunology. А ручками не буду, некогда.

---

</blockquote>
Скорее всего - никак не переводили. Он уже существует онлайн:
http://www3.interscience.wiley.com/reference.html
Просто кто-то с доступом не поленился скачать.
(NB! только если кто вздумает скачивать - робота на этот сайт напускать бесполезно - мало того, что накачает лабуду, так ещё и издатель передаст проблемы через местного сетевого администратора. Так что надо постранично, и по немногу.)

В Москве (точно у кого-то в ИМБ, ИБГ и ИОГен) существует диск на котором записана открытая версия Current Protocols (не только Molecular Biology, но и ещё Immunology, Protein Science и т.п.) онлайн вариант Molecular Cloning, плюс программы. Поспрашивайте - наверняка найдёте.

Redactor
Malfet
У меня официально купленные CPMB и CPI на CD. Вернее, на CD есть все CP (в количестве штук 15), но ключи были куплены только к этим двум. Причем это была подписка на 1 год, раз в квартал выходили обновления, при этом предыдущая версия переставала работать (чтобы запустить, приходилось переставлять системную дату на правильный квартал). По окончании подписки мне издательством были сообщены новые - архивные - ключи, с которыми теперь все работает при любой дате, только все время напоминает, что надо бы возобновить подписку. В общем, геморрой тот еще, а сколько времени я провел на телефоне, дозваниваясь до их тех. суппорта - это вообще тихий ужас. Поэтому и не чувствую угрызений совести, раздавая копии направо и налево. Тем более что данные архивные (MB на 2001 год, Immunology на 2002) и с каждым годом будут устаревать. Но выкладывать в интернет все-таки неохота.
Данные там запакованы в один большой большой файл (один на каждое из изданий) + какие-то файлики поменьше, что за формат - фиг его знает. На диске есть программа по имени Teton Viewer, которая с этими базами и работает, если вставить правильные ключи.

Хочу остудить энтузиастов. Качество Маниатиса - отвратительное, предметный указатель практически не читается. На бесптичьи, конечно, и это сойдет.

А как была обнаружена ссылка на
Current Protocols in Cell Biology(9Mb,HTML)?
На странице http://biosoft.biosino.org/book.html ее точно нет...
Может там еще чего-нибудь полезное найти можно? Кстати, нет ли у кого Current Protocols in Cytometry?

Ссылки взяты со страницы какого-то "Hoyoyo".
Похоже, он главный китайский спец по мол-био и биохимическому софту. По-крайней мере, если набрать в Гугле это имя, то всплывает куча сайтов с примерно одинаковым содержанием и везде есть его emailы.
Если кому-то удастся докопаться до других интересных файлов на этих сайтах, дайте знать. Неплохо было бы конечно найти какого-нибудь китайца, чтобы помог разобраться...

DVKup
Ну а сохранять просматриваемый текст в какой-либо формат из этой программы хоть можно? Потому что конвертеров из неизвестно как запихнутого в прогу текста в html конечно нет, ибо неведомо в каком виде там пребывает текст...

<High-Downloader>
Странно, у меня индекс читается вполне сносно, все остальное - просто отлично. Может, что-то не так с экраном или с принтером?
Malfet
Кнопка сохранения неактивна, но можно печатать в какой-нибудь виртуальный принтер (Adobe PDFWriter или Distiller). Проблема в том, что нельзя выбрать сразу много страниц или целый раздел для печати.

DVKup
Ну если можно печатать в PDF то проблема исключительно в том, чтобы минимизировать количество файлов. Хотя бы по полраздела сразу печатать. Ну а готовый PDF открывается Fine Reder 6 (пятый не годится), распознается и сохраняется в HTML с сохранением начертаний шрифтов. Потом оный ХТМЛ можно и в файл-справки конвертнуть если там картинок много. Размер, естественно сильно уменьшится.
Обитал бы в Москве - чтобы диск переписать - занялся бы, дела то на один вечер судя по всему...

Malfet
PDF и так получается текстовый, распознавать ничего не нужно. Проблема две: файлов дюже много (по десятку на раздел) и не сохраняются работающие гиперссылки. То есть либо возни слишком много (печатать все это в маленькие файлики, потом собирать вместе, потом вручную расставлять ссылки), либо полученный продукт сильно уступает удобством исходному. В любом случае жалко тратить время, особенно если вспомнить, что текст будет морально стареть.

Вот решил выложить оглавления моего диска, о котором идет речь. Ценные тексты из этой ветки туда уже добавлены, пришлось пожертвовать 6-м фотошопом, 6-м IE и 7-м Netscape. Диски для Pazhit и других желающих пока не записал, так что comments welcome (список папок с краткими описаниями содержимого):
-------------------------------------------------------------
Acrobat5 - Acrobat 5.0 (full version, not Reader) with update
s/n inside Acrobat5 folder (file Acrobat5/serial.txt)
CPI - files for Current Protocols in Immunology
CPMB - files for Current Protocols in Molecular Biology
installation keys in file serial.txt
CPCB - Current Protocols in Cell Biology, no working links
Start with CPCB/INDEX.htm
Cytokine_reference - from http://www.academicpress.com/cytokinereference/
PDF files only
Hematology - from http://pathy.med.nagoya-u.ac.jp/atlas/doc/
Start with Hematology/index.html
Immunology - an older version of textbook in immunology
from http://www.whfreeman.com/kuby/
Start with Immunology/index.html
then follow "download chapters in pdf format" link
Necropsy - guide to mouse necropsy from
http://www.geocities.com/virtualbiology/necropsy.html
Start with Necropsy/necropsy.html
Maniatis - Molecular Cloning, 3rd edition, from
http://biochemsoft.biosino.org/swdlll/cai/...ularCloning.zip
Genes_VII - Lewin,GENES 7th edition, from
http://biochemsoft.biosino.org/swdlll/cai/genes7.zip
--------------------------------------------------------------------
Software - other useful soft:
3Dfish
Bin2ISO
CloneCD
Cn3D
CryptEdit
Cyclone
FAR
GENE
IView
NeatImage
NERO
RefMan10
RefMan9
SecCRT
qe.exe
rk.com
--------------------------------------------------------------------

Друзья, у меня тоже плохо читается Molecular cloning с этого сайта. А при печати получается просто черныи лист.
Если кто справится с этои проблемои, может как-нибудь (хотя бы на диске, я болванку верну ) переправите его мне, очень уж хотелось бы его поиметь. А сам я в этих делах ничего не понимаю....
Заранее спасибо, Степа
[Текст переведён с транслита]

DVKup
PDF файл это по определению картинка. Он на основе PostScript'а придуман - и в HTML, т.е. чистом тексте будет весить на порядок меньше - плюс все ссылки "автоматически" (ну почти - пара команд для арахнофилии проявятся
А сколько там разделов? Если 5-ть это одно, а если 50-ть - то совсем другое.

Stepa
Скажи номер страницы, которая не печатается, я проверю. У меня все пучком - Acrobat 5.05, Windows ME, HP LaserJet 1220. С PDF файлами такие глюки бывают, может надо версию Акробата сменить или на другом принтере напечатать.
Malfet
Что значит по определению картинка? В Постскрипт файле находится текст, который безо всякого преобразования вставляется в любой текстовый редактор, и, вероятно, Postscript шрифт, что может иметь значение для маленького файла, ну и у HTML своя служебная информация есть. В общем, отличие непринципиальное, может раза в полтора - уж поверьте, я проверял.
Сейчас проверил - эта сволочь не только записывать не хочет, но и копировать через буфер - тоже (archive copy limited to 255 characters), так что печать в PDF - это единственная опция сохранения. Печатает только пофайлово. Ну, а количество файлов я попробовал оценить - в Molecular Biology 24 главы, я взял наугад 16-ю и пролистал все файлы, из которых она состоит, подряд, просто ситая их. Получилось 250. Может мне не самая маленькая глава попалась, но я думаю, что 5000 - это разумная оценка количества файлов, которые надо напечатать. Как, коллега, энтузиазм еще сохраняется, или придете за диском ?

Да, возможно, дело в Акробате У меня 4.0
А где достать поновее версию?
Прошу просчения, я в этих делах полныи дурак
[Текст переведён с транслита]

А может, и не в Акробате дело. Я сейчас попробовал из 4.05 напечатать (Win 95, DeskJet 400) - тоже все нормально. Попробуй в акробатовском диалоге печати поставить (или, наоборот, снять) галочки "fit to page" и "print as image", это может помочь.
А если в Москве - заходи в гости с пустой болванкой.

Stepa!
если не лень - пиши мне на мейл свой почтовый адрес - я тебе закатаю на диск много всего у меня имеющегося - всякие там разные акробаты и пр. и отошлю - из Японии за три-четыре дня дойдет наверно..
[ 23-07-2002: Сообщение отредактировано: Olezhek ]

DVKup
Да-а, 5000 файлов это весомо Зайти за диском надо бы - коли в Москве буду, али поедет туда кто из соседних лаб.
Stepa
У меня тоже все нормально читается, т.е. качество там конечно не идеальное - но читается без проблем.

To DVKup
Спасибо за совет, я попробую.
Нащет зайти - куда там, я сейчас в Геидельберге, а через неделю - домои в Новосибирск прямым рейсом
To Olezhek:
Спасибо за предложение. А если прямо в Новосиборск послать, доидет, как ты думаеш?
[Текст переведён с транслита]

Проверял - доходит за 4 дня...в общем если что - пиши на мейл адрес и желаемый софт - у меня много )))

Коллеги!
Не подскажет ли кто как пробраться в онлайновый Маниатис третьего издания?! (Адрес, ключи ?!)

Там нужен адрес почты и пароль,
Я там смотрел, мне не очень понравилось, лучще иметь бумажный вариант или пдф про него уже здесь писали.
ЗЫ А печатется он у меня очень хорошо....
[Текст переведён с транслита]

All:
Описанный выше диск с софтом заметно улучшился - теперь есть все Current Protocols, не только Mol Biology и Immunology. Работает с небольшими глюками, но - работает! Копии диска я по-прежнему готов давать всем желающим, вернее, тем кому удастся со мной пересечься. Практика показала, что это непросто.

Огромнейшее СПАСИБО за предложение!!!
Буду в Москве, непременно загляну.

Уважаемые коллеги!
У меня почему-то rar не хочет открывать файлы CP. Не подскажете, в чом может быть загвоздка? Или у меня rar староват? А каким Вы пользовались?

<smith>
А что это за файлы и почему их надо открывать RAR-ом? Насколько я понимаю, файлы CP имеют какой-то свой собственный формат, который читается программой Teton Viewer...

Наверное, имеется в виду формат ISO, т.е. образ CD-диска.
Действительно, последняя версия WinRARа 3.0 может просматривать контент и извлекать отдельные файлы из такого архива:
"WinRAR 3.0 is able to browse and unpack contents of ISO files".
Только, как заметил уважаемый DVKup, зачем это в данном случае? У меня, к сожаленью файла CP_on_CD.iso еще нет, но чисто умозрительно, я могу посоветовать работать с ним с помощью
какого-либо CD-эмулятора типа Daemon Tools. Второй вариант - перенести образ на диск какой-нибудь CD-пишущей программой (разумеется не простым копированием файла).

to DVKup:
Не будете ли так любезны сообщить мне, за какой год у Вас CP?
И еще, в чем конкретно заключается глючность, о которой Вы писали?
Спасибо.

Ежели pdf не печатается - это может быть связано с используемым принтером, драйвером принтера или и его настройками. А если не (или плохо) читается, то 100% - криво скачалось или скопировалось с ошибками.