Вот, коллеги, возникла следующая проблема: похерился дивидюк с дистрибами цитометрическим для Виндов (Summit, Expo и прочий приятный софт ).
В данный момент работаю со Скалибурами в основном- соответственно весь софт, который имеется- МаКовский.
А данные аналайзить, как обычно, на своем ноуте (точнее-DT-replacement-е) предпочитаю. Но , сами понимаете: под WinMDI многоцветку с кучей гейтов гонять- смерти подобно
А посему вопрос: нет ли у кого дистрибов видузовых цито-варезов?
Заранее благодарен.

считаю что под винду пока ничего лучше Flow Jo нет
но варезнуть, найти кряк для него и проч. халява - анрил
сам уже год ищу
вроде есть какая-то халявная супер-бета версия, но не знаю насколько она надёжна и работает ли вообще

здесь смотрел? -
http://www.cyto.purdue.edu/flowcyt/software.htm

PS: о боже как я устал от 4 цветов - ничего сделать нельзя!!! всегда надо 5

Хе, на "Пердях"- только фриварезы лежат. Я этот линк уже лет 6 юзаю
У меня FlowJo есть бета- но ведь корявая, сволочь: только с фирменными демо-файлами работает. И не ломается.

P.S. Експо- нехуже, но блин... ее фриваре нет- а диск похерился

Ну так что, нет что ль ничего?

P.S. А разарботчики FlowJo- мудаки: зарегился у них на сайте на 30-дневный trial- так уже 3-й день обещанного активационного ключа жду..Сцуки...

Может хоть FCS-Express V2 у кого-нить крякнутый есть? ПА-А-АМИРАЮ,,,

Ну, я всё про тоже. Когда нет возможности в CellQuest поработать пользуюсь FCS Express 2. 4-х цветка нормально аналикается. Помоему, из халявного софта самая приемлемая програмуля для многоцветки.

ЗЫ: Дядюшка, никак в макаронию перебрался? Я этой Roncarolo как-то CV засылал - не прокатило.

О, таки решился!
Крякнутого нет, но я ничего умней придумать не смог, как тупо календарь на компе назад отматать. Работает

Угу- перебрался.
Только не к Ронкаролло.
А насчет FCS-a- конфиг файл есть?
А то мне сии гады ( denovosoft) его тоже не прислали...

Тебе файл на pisem.net слать?

Ну, как там?

Ага
Именно туда

Уже отправил

Получил- спасибо!

To Дядя ФАКСер & other

Может сделать раздел на molbiolsoft по цитометрическому софту? Тогда и потеря носителей будет не так страшна...

Разумно.
Поддерживаю.

Тогда не возмете на себя труд составить список программ и кратенькие описания к ним и по возможности сделать скриншоты. ;-) Ну а как обменяться кряками или дистрибутивами - в ПМ можно обсудить.

Ну дык в свободном виде - нормального софта нет.
А лицензионный- он как правило, еще и хардверно (через usb/serial diskkey) защищен.

Что же касается шароварки/фриварки- то самый подробный список ( в том числе- с описаниями)- лежит тут:
http://www.cyto.purdue.edu/flowcyt/software.htm

А что, неужели нет лекарств ни на одну прогу по цитометрии? И на Вашем умершем ДВД были только фриваре и лицензионные? Если знаете на какие проги и конкретно на какие версии существовали кряки, то их с высокой вероятностью успеха найти можно.

У меня был спизженный из CHLA serial-port key дпя Expo-32- но он прое..ся вместе с диском ( это ж история давняя и известная здесь- как меня в Кепкограде менты чуть не мочканули).
Такие вот дела...

Интересует ли FCS Express Version 3 - есть конфиг файл для нее.
http://www.denovosoftware.com/site/FCSExpressV3.shtml
http://www.denovosoftware.com/download/FCSExpressV3Full.exe

Если да, то откликнетесь - выложу. Сам не проверял, но китайцы пишут, что вроде работает...

Выкладывай конфиг- "Экспресс"- штука хорошая

Конфиг для FCS Express Version 3 выложил на сайте в разделе "Архив патчей" - проверяйте работоспособность.

Сорри за задержку.

To Дядя ФАКСер:
Так конфиг для FCS Express подошел? Рабочий?

Сорри, я пока не проверял...
У меня тут Макинтош лишний с целквестом обнаружился - на нем гоняю пока данные.

Спасибо за конфиг. Всё работает.

если кому интересно - есть дистриб summit'a. не поверите - одно время на халяву лежал на саите cytomation (пока они с dako не поженились). не демо. конечно против flowjo под mac не катит но всяко лучше winmdi...

Если не затруднит, перешлите на molbiolsoft@rambler.ru - выложим на сайте в общий доступ. Только разбейте на части мегов по 5, пожалуйста.

Саммит - это дело.
Правда- у него часто глюки бывают c прочтением файлов данных от не-DAKO-вских цитометров.

2 yaden - он 60 метров почти весит. может есть какои-нибудь более гуманний е-маил account- а то я резать и слать устану?

2Дядя ФАКСер - не фига, это все настоиками лечится - в хелпе все описано. я олично работал с фаилами и с calibur'a и с epics'a.

подсознание... не 'настоиками' а 'настроиками'... ;-)

To Kreslavsky - к сожалению нету. Даже преславутый гмэйл только 10 Мб за раз может, как и рамблер. Но лучше по 5 Мб - так легче и мне стянуть будет.

блин. я порезал ровно по 5 мб. "Мессаге сизе ехцеедс фихед лимит" у тебя макс размер входясчего что ли 5? тади надо мельче резать - оно при отправки распухает... предупреждать надо. короче - изисчите какой-нибудь менее геморойний для меня способ. на фтп куда-нибудь загрузить - или что-то в таком роде...

Kreslavsky: спросите у модератора Heckfy "параметры" доступа к здешнему серверу программ и качните его по ftp туда... а уж оттуда...

To Kreslavsky. Сорри за неудобства, но только что прочитал, что рамблер ни с того ни с сего уменьшил размер аттачмента до 2 Мб при объеме ящика в 100 Мб - редиски.

Если не сложно - можете сюда тоже архивами по 5 Мб - biochim(a)bas-net.by

[censored]
Connection timed out with smtp.bas-net.by.
Warning: message still undelivered after 4 hours
Will keep trying until message is 5 days old
[censored]

zakolebalo.

To Kreslavsky - все успешно дошло, спасибо. На днях выложу на сайте.
Сорри за неудобства - просто у нас на один день всю академию наук страны лишили инета, вот ящик и поругался, хотя все дошло.

ну и отлично! нужни будут комментарии как настроить под работу с разними цитометрами - напишу. вот.

Так залили Summit или нет?

Угу - сегодня-завтра выложу на сайте.

Выложил.
Создал раздел "Программы для цитометрии" в котором выложены FCS Express 3.0 и Summit 3.1. Плюс добавил литературу по цитометрии: Current Protocols in Cytometry и Flow Cytometry Protocols из серии Methods in Molecular Biology

Спасибо- усе пашет на удивление стабильно.

Просто, помню года полтора назад выкладывался архив саммита с какого-то американского сервачка- так там то коннект рвался, то архив коряво грузился...

Добрый день, коллеги!

Сорри, если не туда пишу, но не поможет ли кто справится с проблемой: нужно читать raw data, получаемые на Beckman Coulter GEN-S. Задача - написать свой собственный софт для обработки этих данных, и хотелось бы понять, правильно ли мы этот формат читаем. Поэтому очень хотелось бы иметь программу, которая эти данные гарантированно правильно считывает и показывает (если OpenSource, то вообще идеально).

Прикладываю архив с двумя примерами, там помимо *.dat есть еще и загадочный *.inf...

А родной софт с данным анализатором разве не идет?

он идет конечно, но только на компе подсоединенном к самому анализатору. Естественно хотелось бы иметь все на своем ноуте .

Коллеги, подскажите плз, как применять этот config файл? И почему установленный FSC Express не запускается вобще? Говорит ошибка.

После инсталляции FCSExpress программу не запускать, конфиг- скопировать в коневуху установочной директории FCSExpress. а потом- запускать искомую программу. И- не апдейтиться он-лайн (иначе- полный краш).

Чрезвычайно любопытная программа для визуализации циотметрических данных

Дык, что ж я... понимаю. Так и делал... нифига. И дома попробовал - то же самое. Что может быть а?
Спасибо за отклик!

А вобще, по ходу дела у меня возник еще вопрос. Это ВОБЩЕ возможно - обрабатывать файлы, создаваемые CellQuest Pro, на другой программе и уже не в MAC а в PC? Там такие типа day1.001, day1.002...
Создается всечатление что нет :-((((( Неужели буду вынужден делать всю обработку прямо у Машины.... :-((( Это ж жуть, там монитор - смерть зрению.

Все нормально он обрабатывает - они в формате FCS 2.0 создаются. Их даже WinMDI спокойно кушает.

Я вот какой софт нашел, называется FLOW:
http://galen.dulci.duhs.duke.edu/flow

а вот к нему статья с картинками:
http://www.scfbm.org/content/3/1/10

первые материалы по этому проекту появились в феврале 2008.

мне кажется, это будущий ImageJ для проточной цитометрии, даже круче, т.к. не на JAVA а на Python. Короче пора учить Python потому что без него даже документацию не скачаешь