Собственно термины встречаются в базах NCBI, не очень ясна разница между ними. Заранее благодарю.

Hypothetical protein = "возможно существующий", "гипотетический" белок.
Белок, само существование которого неизвестно. Упор на "возможность существования" этого белка, по смыслу близко "белок Х", "неизвестный белок", иногда даже "недостающее звено".
Чаще всего используется, когда во время анализа генома при идентификации гена находят open reading frame, при этом в базе данных не содержится белка, который можно соотнести с таким сиквенсом и неизвестно транскрибируется ли этот сиквенс вообще. Иногда также, при построении схемы какой-то цепи реакций, полная структура которой неизвестна, чтобы свести концы с концами в нее вводят вот такой "hypothetical enzyme/protein". Т.е. существование такого белка "предсказывается", но в действительности такой белок неизвестен или неизвестно какой именно белок выполняет данные функции.

Putative protein = существующий, известный, очень часто даже неплохо охарактеризованый белок, особенности/детали структуры и функций которого предсказывается из каких-либо умозрительных или логических постоений, и/или экспериментальных данных; часто близко по смыслу к "возможная модель строения/функций белка", "возможная схема строения", вероятный способ функционирования" итд

Более конкретный пример:

Hypothetical Ca-binding site = место, ВОЗМОЖНО СПОСОБНОЕ связывать кальций (т.е. "теоретически" предполагается, что белок или участок белка может связывать Са, но неизвестно, действительно происходит ли такое "на практике", "в жизни").

Putative Ca-binding site = ВЕРОЯТНОЕ место связывания кальция, (Ca действительно связывается с белком, предполагается что по этому месту).

Спасибо, Гость!

А predicted protein - это то же самое, что hypothetical или смысл немного иной?

Интересно, а бывают theoretical proteins?