Добрый день!
Подскажите пожалуйста как лучше искать паралоги определённых генов в человеческом геноме? Нашла GeneCards, но может быть это можно сделать в UCSC (что-то пока не могу разобраться где искать соответствующую функцию)?
Спасибо.

Попробуйте еще KEGG. http://www.genome.ad.jp/kegg/
но не факт, что там есть то, что нужно...вообще все это только все раскручивается!!!!!я бы для начала попробовал привлечь на помощь BLAST. если там была дупликация, то гомология достаточно высока. а потом можно быстро посмотреть в PUBMED ген, гомологию с которым покажет бласт...может есть статья, что он является паралогом вашего гена

Спасибо!
В том то и дело что если искать через BLAST получается очень уж затратно по времени и не совсем удобно, если это нужно сделать для большого количества генов.
KEGG попробую.
Нашла всё-таки в UCSC кнопочку - genomicSuperDups, но она работает только с фрагментами >1000 kb.

Да, в KEGG паралоги можете посмотреть по этой ссылке http://www.kegg.com/kegg/genes.html

В ensembl.org есть все, что душе угодно.

и правда