vjush, 27.08.2010 19:34
Добрый день! Несколько недель в теме, поэтому ещё не совсем в ней! А тема поставлена следующая: "обнаружить генетические изменения в лактококках приспособляемых к неблагоприятным условиям:1понижение температуры; 2. сокращение питательных веществ в субстрате. Анализ 1, 50, 100, 300 перевивки." Какие пит. вещества имеются в виду узнаю в понедельник. Что и как отслеживать, меняются ли они генетически, с помощью чего отследить - пока для меня вопросы. Но начальство сказало... Если кто-либо сможет помочь грамотно и адекватно составить тех. задание, а еще и выполнить его буду рад. Цену вопроса обсудим в личке:0)
бутанол, 04.09.2010 14:29
ну блин.
если речь бы шла о селекции т.е. имеем генетически неоднородную популяцию и смотрим как меняется соотношение генетически разнородных М.О. заодно можно было бы получить данные о механизмах адаптации включая генетику...
а так давайте представим какова частота мутаций на 1 млн п.н. в процессе репликации, каков объем биомассы и соответственно ДНК будет сгенерирован в ходе опыта и соотвественно сможет быть подвергунт мутациям адаптивного характера.
а еще надо будет вычесть отсюда такие вещи как
вы же не будете создавать условия изначально летальные для всех нормальных клеток, вы же всего лишь создадите условия при которых одна единственная удачно мутировавшая клеточка сможет делится с большей эффективностью чем остальные, правда?
отследить предлагаю по VNTR полиморфизмам для начала, дабы разделить полученный в итоге пул клеток по генетическому полиморфизму (хотя шансов, если культура чистая будет немного) а потом полногеномное секвенирование нескольких различающихся изолятов (тыщ за 300 рублей 1 изолят)
если сузить круг поиска до конкретных генов то все будет дешевле
вариант 2 метаболомный подход смотрите как меняется метаболизм исходя из анализа большей части метаболитов потом можно будет подумать о генах ответственных за тот или иной метаболический путь
в общем лактобактериями мы занимаемся, если интересно пишите lisocim@mail.ru