Коллеги и специалисты. Вот, появилась такая микро-задача.

Есть у вас Excel или обычный текстовый файл в котором, скажем 100 строк и каждая строка - это отдельная нуклеотидная последовательность.

Как легко и непринужденно каким-нить хитрым способом сделать из такого файла файл Multi-Fasta так чтобы каждой последовательности (т.е. каждой строчке) было присвоено имя, например Sequence-1, Sequence-2 и т.д.

Заранее большое спасибо!

Excel:

A B C
1 > seq1_ АТГЦАГТАЦАГАТАГАЦА
2 > seq2_ АЦТАГАЦАГТАГАЦАА
3 > seq3_ АЦТГАТАГАЦАГА



скопировать в Word
убрать пробелы
найти и заменить _ на ^p

Спасибо! Но это понятно. Нужно вот как.

На входе

АТГЦАГТАЦАГАТАГАЦА
АЦТАГАЦАГТАГАЦАА
АЦТГАТАГАЦАГА

и что бы на выходе было

>seq1
АТГЦАГТАЦАГАТАГАЦА
>seq2
АЦТАГАЦАГТАГАЦАА
>seq3
АЦТГАТАГАЦАГА

Вручную-то я умею. Просто когда массив из 10000+ последовательностей и таких массивов много, - хочется чего-то более нано-технологичного

1. в экселе в колонку В ставим ваши последовательности.
2. в колонку А ставим >seq1 и "протягиваем", схватив за нижний правый угол ячейки до необходимого >seqN (эксель сам номера проставит)
3. копируем два столбца в ворд
4. в ворде преобразовываем таблицу в текст (таблица/преобразовать/таблцу в текст), выбираем преобразование с разделителем "знак табуляции"
5. делаем замену всех знаков табуляции ^t на знаки абзаца ^p
на всё 2 минуты.

Коллеги, уууууууууууууууу! Жизнь стала проще и радостнее!

Спасибо огромное!!!!

Ага, всё. Понял что вы имели ввиду то же самое что и следующий докладчик.

Пардон, что доходит до японских ущеных все туго.

Спасибо!!!!