привет всем.

сделала фотки микроскопной камерой, сохранились в raw. только теперь ни сама изначальная программа (каппа имаджбейс) ни что-либо еще не может их открыть и конвертировать. попробовала уже штук 5.
скажите что делать????

переснять не предлагайте))

а попробовать открыть на микроскопном компе?

Это формат Фото-Шопа, на ём и открывайте.

Используйте ImageJ. Только надо бы еще знать размер кадра, структуру заголовка, 8- или 16-бит и порядок байтов. Пришлите на пробу картиночку, может, соображу...

программа которая сделала это извините Г не может его же открыть. сама не понимаю почему.
фотошоп тоже как-то странно говорит что не знает как это открыть.

ту Электрон,

молбиол говорит что я не могу загружать данный тип файлов. забавно да?

может мыло дадите???

raw можно попробовать открыть в последних версиях фотошопа (там есть camera raw). Есть куча и других прог в т.ч. и бесплатных. Например libraw, rawstudio, ufraw...

попробовала, ничто не открывает. уж наверное я догадалась погуглить перед тем как создавать тему

XnView бесплатная, открывает и конвертирует. FastStone открывает.
Если совсем ничего не получится - скиньте на файлообменник, ссылку на файл и свой адрес мне пришлите, переведу в jpg

Так файл, поди, повреждён...

faststone говорит что неподдерживаемый формат, XnView открывает, но картинка крайне далека от того что было или должно быть

http://files.mail.ru/PIV872
4 пробничка

может конечно быть и так, но с чего вдруг. они сохраняются на том же компе, я их даже не переносила. и потом все 40 не могут быть повреждены

а что за камера? (марка, проиводитель).

действительно, марку камеры было бы полезно узнать. Ну или хотя бы предполагаемые параметры изображения: разрешение (а лучше размер в пикселях) и цветность.

короче открыл в фотошопе DAPI 1. там какие-то полосы невнятные
либо так, либо файл поврежден

OK, судя по картинке, ошибка в размере заголовка. Кидайте исходный (ну и всю дополнительную информацию, см. выше) сюда (electron@libro.genebee.msu.ru)

у неё там двумя постами выше дана ссылка на файлы

а, еще можно, пжалста, точные размеры матрицы в пикселях

to electron: открылось в 8-битном формате.

камера от KAPPA серия DX40, больше вообще никакой информации ни на камере ни вытащить из компа. даже на сайте производителя нет инфо по этой серии камер.
так что извините, но ни матриц ни чего там еще спрашивали....

ksm, как вы сами понимаете файл с названием дапи так не может выглядеть

а никаких других картинок (в любом формате) с этой камеры нету? раньше-то она хоть работала когда-нибудь?

камера работает, есть несколько другой вариант сохранения с нее и тогда софт предлагает формат выбрать, jpeg и все прочее читаемое, но есть и другая кнопочка, которая тоже предлагает сохранить а вот как не спрашивает. делает этот роу и потом сама же программа не хочет его открывать

на камере написано если это важно

0,63x:2/3"=^17,5

откройте как раз "все прочее читаемое" и посмотрите, какой там размер картинки

Связываться с производителем по-моему единственный выход. Фотошоп не открывает, гимп не видит, Quantity One и иже с ними тоже его как 16-битный тиф не видят.

ну не то чтобы прямо единственный. Обычно в raw-файлах картинка записана тупо битмапом, после заголовка. Т.е. если знать размерность картинки и перебрать разные варианты смещения (т.е. размер заголовка), то изображение можно вытащить. Я так делал с fuji-вскими картинками.

Вот и я о том же. Слишком много параметров. А производитель должен знать хотя бы основные параметры картинки.

Итак: картинка в формате RAW 16-bit Unsigned, little-endian byte order. Размер 1300х1030, заголовок я оценил в 2638 байт (для эстетики, чтобы рамка была по всему периметру).
Открывать так: ImageJ - File -> Import -> RAW и забиваете вышеуказанные параметры в соответствующие поля.

От себя добавлю: ну и ДАПИ у Вас!!! ДНК гидролизовали или это терминальные стадии некроза?
Далее: надо бы flat field correction делать, а то у Вас столько мусора на оптике.

Успехов!

спасибо большое, но ведь получаются не цветные картинки?

а это, цветные получить никакой возможности нет ли???

пс да дапи подкачал))

Так у Вас камера не цветная, соответственно раскрашивать надо самой.
Итак: в ImageJ открыли картинку, затем Image -> Lookup Tables -> выбираете нужное (для ДАПИ я люблю Cyan). Затем, если хотите экспортировать в другие программы: Image -> Type -> RGB Color.
Другой путь (если нужна многоцветная картинка для оценки колокализации):
открываем картинки со всех каналов -> Image -> Color -> Merge Channels и приписываете нужные цвета отдельным файлам.
НО есть и масса других способов - ищите (в ImageJ) и обрящете.

как это не цветная, очень даже.
вот кстати если сохранять все правильно то такая красота

все прочее размера 644х509

Это у Вас софт сильно умный. Может, он и в заголовок что процвет записал, а базовая картинка серая. А если цветная, то это не совсем правильный выбор для флуоресцентной микроскопии (вот если у вас микроскоп не моторизованный а сигнал яркий и хочется колокализации с хорошим разрешением, тогда....) Что касается размеров - так это как Вы решите (ROI, binning и прочее предусмотреть невозможно).

можете конечно надо мной веселиться, я не спец по технике, потому и прошу помощи.
кстати вот за помощь вам ОГРОМНОЕ спасибо!!!

немцы просветились на счет молбиол, очень удивлены что незнакомые люди безвозмездно помогают

это у вас какие-то немцы сильно непросвещённые: молбиол, слава богу, не один такой - форумы типа protocol-online или bio.net живут и здравствуют с начала времён интернета

Милости просим, заходите еще

да еще и дурноватые судя по всему раз сразу сдались, сказали что это невозможно и не теряй времени

Просто офигеть. Неужели опытным путем? Как же вы размер вытащили? Перехожу на ImageJ.

да программка оказалась чУдная, я уже все пересохранила и играюсь цветами))))

Элементарно, Ватсон: коротенький макрос по перебору размеров кадров и длины заголовка. Желательно только иметь 64-бит ОС и побольше RAM, а то памяти не хватит

есть программка FastStone Image Viewer, она и открывает, и в нормальную кодировку перегоняет пакетно.

Автор пробовал эту программу без видимых результатов.