Полная версия страницы  English  

Титрование вируса

AE, 09.09.2005 20:14
Продолжу в заданном редактором стиле.

Одну научную сотрудницу рецензент попросил для статьи выразить концентрацию вируса в ее пробах в lgTCID50 (Tissue Culture Infecting Dose 50%)

Засеяла она 96 луночную плашку десятикратными разведениями в восьми повторах на каждое, по 25µл в лунку, подождала до проявления цитопатического эффекта, зафиксировала и покрасила (там где были живые клетки лунки остались синими, где вирус все поубивал, ясное дело, прозрачные. Получила плашку сидит и думает сколько же lgTCID50 в мл.


Ответ с 5% точностью:   
      



/ Сборник задач,  #43800  /
Первые решившие: guest_n, Turchinovich, arumyantsev, Sonja_ro, Pit, CowDoc (из 10 // осталось: 4)
Область: Микробиология (бактериология, вирусология, микология)
Характер и уровень: Простые (расч), Простые (опред)


Картинки:
Plashka.jpg - кликните, чтобы открыть увеличенную картинку
Plashka.jpg — (55.32)   

gostya, 10.09.2005 22:09
a Ig это что такое?
gostya, 10.09.2005 22:18
понятно, log 50% tissue culture infective dose
gostya, 10.09.2005 22:25
по идее 6,5?
AE, 12.09.2005 10:13
(gostya @ 10.09.2005 21:25)
Ссылка на исходное сообщение  по идее 6,5?


Тепло. Читаем внимательно вопрос.
гость: г, 12.09.2005 23:57
в восьми повторах говорите? нарисуйте повторы для начала, а то похоже, что у этой лаборантки, для который научный сотрудник разводил сыворотку десять в минус первой рука с перепою дрожала.
Redactor, 14.09.2005 13:37
Может быть, для таких задач стоит в открытом комментарии давать некоторые определения?

То есть, это не обязательно, но если бы было приведено определение и расшифровка "lgTCID50", то задачу попробовали бы решить не только вирусологи, но и биологи других специальностей.

Это бы поспособствовало расширению кругозора smile.gif .
bukach, 15.09.2005 01:14
(Redactor @ 14.09.2005 14:37)
Ссылка на исходное сообщение  Может быть, для таких задач стоит в открытом комментарии давать некоторые определения?

То есть, это не обязательно, но если бы было приведено определение и расшифровка "lgTCID50", то задачу попробовали бы решить не только вирусологи, но и биологи других специальностей.

Это бы поспособствовало расширению кругозора smile.gif .


не факт. а в данном случае расшифровки Tissue Culture Infecting Dose 50% вполне себе хватило. а "расширению кругозора" больше способствовало копание в гугле в поисках того что ж это за зверь такой и с чем его едят smile.gif (я далеко не вирусолог, про lgTCID50 в первый раз слышала). если бы формула была исходно написана, то это понятие так бы и осталось для меня абстрактным, а так, в контексте выкопанных попутно статей хоть малой толикой практической "плоти" обросло.
к тому же, если уж совсем не будет получаться, то автора задачи можно будет попросить задать наводящий вопрос wink.gif (благо для каждой задачи свой топик).

AE, спасибо за задачу
Redactor, а Вам - за идею этого раздела и его воплощение smile.gif


з.ы. решила ее не с первого раза - и меня в список решивших не внеслииии weep.gif
gostya, 15.09.2005 02:32
я не понимаю, как логарифм может быть в мл confused.gif
AE, 15.09.2005 03:36
(gostya @ 15.09.2005 01:32)
Ссылка на исходное сообщение  я не понимаю, как логарифм может быть в мл  confused.gif



Логарифм не может измерятся в милилитрах. Тут вы совершенно правы.
Размерность ответа должна быть lgTCID50/мл

Грубо говоря
Для каждого вируса существует некая "Доза заражающая 50% экспонированных клеточных культур" - TCID50
Кстати, абсолютная аналогия, например,"50% летальная доза" (LD50)

Любую дозу вируса тогда можно представить как X TCID50, a концентрацию вируса в неком препарате как Y TCID50/мл, но чаще пользуются десятичными логарифмами этих величин и пишут Z lgTCID50 или S lgTCID50/мл
gostya, 15.09.2005 16:33
теперь понятно smile.gif
Значит, задачу по идее можно было бы сформулировать так: 10 в минус какой степени л вируса надо добавить к 1 мл среды культивирования, чтобы получить 50% смертность, это первое, второе - на рисунке разведения сдвинуты на одно влево, т.е не показано разведение 10 в 0, поетому если не смотреть внимательно, то ответ получается на 1 больше, мне кажется рисунок надо перерисовать
AE, 15.09.2005 19:32
(gostya @ 15.09.2005 15:33)
Ссылка на исходное сообщение 
второе - на рисунке разведения сдвинуты на одно влево, т.е не показано разведение 10 в 0, поетому если не смотреть внимательно, то ответ получается на 1 больше, мне кажется рисунок надо перерисовать


Э-э-э так не пойдет. smile.gif
Ничего перерисовывать не надо. И никуда разведения не сдвинуты. А с чего это оно должно быть это разведение 100. Если вас смушает отсутсвие надписи у двенадцатой колонки, так считайте, что там вируса вообще нет. Просто негативный контроль, только среда для клеток. Вполне реальная ситуация. А смотреть, как раз, и надо внимательно. Это как на теорэкзамене на получение водительских прав. Надо воспринимать всю информацию на картинке. smile.gif
gostya, 17.09.2005 18:51
может я совсем того, но 6 из 8 это 75 %, 2 из 8 это 25%, то что между это 50%
Guest, 20.09.2005 11:15
если не 6,5 , то неужели -6,5?!
AE, 20.09.2005 14:22
(Guest @ 20.09.2005 10:15)
Ссылка на исходное сообщение  если не 6,5 , то неужели -6,5?!


Нет, не минус.

Но если в 25мкл находится 6,5 lgTCID50
то в 1 мл сколько?

ps; Редактор, а есть ли возможность открыть просмотр решения для всех, раньше чем наберется 10 решивших зарегистрированных участников? Или надо решение выносить в обсуждение?
gostya, 20.09.2005 18:08
так понятно, изврат какой-то, тогда то что я писала про степень литров неправильно
AE, 21.09.2005 16:12
(guest_n @ 20.09.2005 19:34)
Ссылка на исходное сообщение  Простите, но это заумь или я тупой совсем.
Как же я решил????
наверное там ответ не правильный


Ну не знаю. Ответа я не менял, так что значит вы решили в пределах 5% ошибки. Ее все равно машина считает.

А про "заумь" и "изврат", то звиняйте, бояре, если не угодил. Тут ведь как. Мне вот все кажется наоборот очень логичным.
Sofia, 04.10.2005 14:03
хорошая задачка, вполне решаемая
CowDoc, 25.10.2005 11:45
Гы, интересные детские задачки, на уровне первого курса. Прям себя крупным спецом ощутил.
Ответ, 8.1 lg ТЦД50/мл Просто вы забыли сделать поправку на объем взятый в титрование, т.е. 25 мкл - это еще плюс 1,60 lg (6,5 + 1,6 = 8,1)
Доброго всем дня.

Ваш правильный ответ, я пока прикрыл. (AE)
AE, 25.10.2005 12:30
(CowDoc @ 25.10.2005 10:45)
Ссылка на исходное сообщение  Гы, интересные детские задачки, на уровне первого курса. Прям себя крупным спецом ощутил.

Уважаемый CowDoc!
Тут ведь как. Я когда постил задачу тоже не думал, что за полтора месяца при тысяче просмотров найдется всего шесть человек решивших правильно с первого раза. И еще примерно столько-же решивших не с первого раза, но в финале запостивших правильный ответ.
Что касается недетских задачек, то у меня к вам просьба. Если их есть у вас smile.gif , то давайте сюда.
 
Просто вы забыли сделать поправку на объем взятый в титрование,

Это к кому замечание. Если ко мне, как к автору задачи, то не забыл. Поэтому ваш ответ и принят программой как правильный.
 
Доброго всем дня.

И вам всего доброго.
Заглядывайте сюда почаще, пожалуйста.
CowDoc, 25.10.2005 14:29
Извините, я правда впервой сюда заглянул, виноват!
Замечание (поправка на объем) конечно же не к вам АЕ, а к другим решившим почти правильно.
По поводу примеров задачек, так в прикладной вирусологии много не придумаешь:
расчитать заражающую дозу, ЛД50, посевную концентрацию, ИмД50, ПД50, а больше то с ходу и не придумаю. Если будет интересно, то можно попробовать составить и кинуть.
Valkiria, 06.01.2008 10:05
уфф, мучалась мучалась пока не дошло что надо лог вычислять!!
CowDoc, 30.11.2011 10:03
Столкнулся, что многим действительно проблематично посчитать. Для своих сотрудников доработал калькулятор, разместил в др. теме http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=490605
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2012 Invision Power Services, Inc.