Когда работаю в Меговском встроенном браузере Мега жутко тормозит.
Сейчас работаю в Меге 5, в четвертой тоже был тормоз.

Что делать, у кого нибудь была такая проблема?

Ну так - freeware! - что вы хотели? Мега хороша для черновых анализов только в виде Neighbor-Joining и простой парсимонии. Для окончательных построений надо пользовать, например, PAUP, который платный (хотя если порыться, то с таблеткой можно найти), или Phylip, бесплантый, но требует усилий, что бы разобраться.

Никогда раньше не использовал встроенный меговский браузер. Сейчас попробовал - ничего не тормозит.