Здравствуйте! У меня вот такая беда: получил данные полногеномного анализа экспрессии генов человека в пробах (на чипе Illumina Human HT-12) в виде файлов Excel. Предстоит задача объединения генов в кластеры и построения тех самых чиповых картинок-схем, которые приводят в статьях. В гугле ничего не нашёл... Пожалуйста, посоветуйте сайты, откуда можно скачать freeware программы, позволяющие это выполнить (если таковые вообще имеются) или сайты с есть web-based-online приложениями для этого.
Огромное спасибо!
 
| |
[ Вход | Регистрация ]
|
Софт для обработки данных полногеномного анализа экспрессии генов
akimovster, 29.04.2011 07:25
J-2010, 09.05.2011 10:14
J-2010, 13.05.2011 02:43
правда для анализа Вам понадобятся исxодные файлы формата idat ....
Guest, 16.05.2011 22:22
R плюс Bioconductor
Инструкции здесь:
Инструкции здесь:
Notch, 05.08.2011 09:17
(Guest @ 16.05.2011 23:22)
R плюс BioconductorИнструкции здесь:
Только там готовые скрипты. Для некоторых задач.
А для нормального решения проблем придется учить язык R...
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.