"Голый" PGM стоит 49,5 тыс.$, но продаётся только в комплекте с сервером (16 тыс.$). Итого - 65,5 тыс.$. Прибор нужен работающий, т.е. его необходимо запустить. А для этого нужно иметь ещё, как минимум, Qubit, DTLite, Ultra Turrax Drive (или Ion OneTouch™), причём стоять это всё должно в лаборатории, уже оснащённой полным комплектом оборудования для ПЦР-диагностики. Стоимость всего такого оборудования (без ПЦР-лаборатории) увеличивает минимальную сумму до 100 тыс.$. В рублях это ~3 млн. Остаётся перемножить 3 млн. руб. на минимальный для России наценочный коэффициент (2...2,5). Отсюда и вытекает минимальная цифра 6 млн. руб., к которой нужно добавить ещё несколько комплектов реагентов, без которых запустить PGM тоже не удастся. Поэтому в России ориентироваться приходится на 6...8 млн. руб., хотя в Штатах было бы достаточно 100...120 тыс.$.

genseq, ясен пень, что тут вам и двух битов с избытком хватило: аудитория форума такова.

есть несколько сайтов, где тусуются те, кто руками что-то понастоящему делают, в том числе с контроллерами, в том числе миниатюрной сервомеханики. У них частенько есть желание сделать что-то для серьезных приложений, но откуда их взять? а в мелкой биологии, да ещё в совсем такой малекулярной знаете ли -- тут вообще у них провал, может и двух пальцев не понадобится, чтоб пересчитаться. в общем получаются у них чаще подводные лодочки, машинки, вертолётики и прочая нужная в хозяйстве утварь

я к чему: однозначно стоит кинуть клич и вообще отстраивать эти отношения.

120%, что рано или поздно дельно срастётся.

Немного "свежатинки" для купирования обострения:
http://www.youtube.com/watch?v=g2s-16r_xCw
http://www.youtube.com/watch?NR=1&feature=...n&v=HJ-UXkoK9ZE
http://www.youtube.com/watch?v=4omZHwE2QI4
http://www.youtube.com/watch?v=0RYB2LEOhWM&feature=relmfu

А это всё уже устарело?
http://molbiol.ru/forums/index.php?act=Att...=post&id=144384

genseq, thanks!

свежатинка про 500 бп на МиСеке
http://www.biostars.org/post/show/54244/ne...-2x250bp-reads/

Коллеги, когда Вы пишете цены, пожалуйста указывайте условия: НДС, условия поставки, гарантия, обучение и прочее.
А то получается, что это как на сайте apple, указана цена, но не указано, что надо платить налог с продаж (который не возвращается).
Это я к тому, что 67 kUSD на рубли это 2,2 рублей.
Я не видел не одного PGM в конкурсах за эти деньги. 5-6-7 миллионов были.

тогда уж дешевле МиСека за 125 Кбаксов при таком курсе УС доллара

http://twitter.com/lambdadmitry/statuses/241159227870162944

http://cores.lifesciences.cornell.edu/brcinfo/?p=news&id=136

А 15 не хочешь

http://zakupki.gov.ru/pgz/public/action/or...ationId=3345398

на поставку комплекта оборудования для проведения фундаментальных и прикладных исследований с использованием ДНК-микроматриц

Диагностическая платформа нашего Центра позволяет тщательно обследовать все органы и системы человека; она включает в себя отделение функциональной диагностики, клинико-диагностическую лабораторию, отделение лучевой диагностики, лабораторию клинических и социальных проблем гериатрии, лабораторию микробиологии, лабораторию клинической генетики

http://www.niigeront.org/home

МиСек не любит ПЦР продукты
http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=20455

genseq, а есть у Вас какое-нибудь техзадание на разработку электроники, пусть и черновое? А то у меня есть немало знакомых железячников, могу что-то поузнавать.

Где-то здесь уже всё выкладывал. Искать лень, поэтому выкладываю снова:
[attachmentid()=156344]
[attachmentid()=156345]
Только предупредите своих знакомых, чтобы в случае использования этих материалов не забывали ссылаться на первоисточник.
Будут вопросы - пишите на E-mail.

genseq, ламерский вопрос - а этот самый PGM чип нельзя ли изготовить самостоятельно или заказать в каком-нибудь технопарке? Может, не такой, как надо, а с меньшим количеством элементов. Есть ли ссылки на литературу именно по PGM?

Вопрос вполне нормальный. Чип изготовить можно. На это уйдёт 1...2 года и 2...4 млн.$.

Если у Вас есть эта сумма, то могу предоставить перечень потенциальных разработчиков. Если сумма меньше (1...2 млн. руб.), то придётся ориентироваться на разработку электроники под уже существующие чипы.

Если и этих денег нет, то талантливый "железячник" способен справиться с этой задачей и своими силами. Если, конечно, проникнется важность решаемой проблемы и перспективами такой разработки.

Так все-таки, можно ли сделать для начала чип на коленке какой попроще (то есть чтобы было элементов на нем поменьше), а потом уже с работающим прототипом клянчить деньги у инвесторов? Это не технический вопрос, а организационный.

В начале 90-х прошлого века еще можно было "выклянчить" деньги (и то знакомству) под сумашедшую ИДЕЮ, а нынче - даже имея на руках сделанный на коленке ЧИП.
Кстати, "копирование" чипов мне напоминает что-то из прошлой нашей, так сказать, истории.. .

Нынче это поставлено на поток и называется венчурным финансированием Но в общем да, под идею денег не дадут, а вот под прототип прибора - дадут.

Сделать прототипный чип тоже можно. Он будет стоить не в 2...4 млн.$, а всего 1 млн.$. В организационном отношении разница не принципиальная.

Проще договориться о кооперации с разработчиками, которые уже имеют такие прототипы. Например:

hassibi.pdf размер: 2.63 кол-во скачиваний: 484

Но и в этом случае договариваться без денег не о чем. Нищие коллабораторы им не нужны.

Иллюстрации к докладу "Будущее геномного секвенирования" (Уфа, 31.10.2012 г., Третья Всероссийская школа-конференция «Биомика – наука XXI века»)

для хисеков 2500 и 1500 - киты на 2х150 , а для торрента - 300
http://products.invitrogen.com/ivgn/product/4480445

http://www.illumina.com/systems/hiseq_syst...ifications.ilmn

протон стоит 150 000 баксов без калкулятора - с калкулятором - 250 000

Немного подредактировал доклад. Убрал фотографию Маши и заменил фото проточной ячейки для HiSeq. Переформатировать не успеваю. Пора идти докладывать. Лейтмотив доклада - "Под лежачий камень мартини не течёт".

лучше бы рекламу ДНК-транспортеров убрали...

Это была не реклама, а антиреклама. На словах я как раз критиковал эту практику.

Как известно, любое упоминание - это реклама, если не некролог

Убрал.

если в России тонны секвенаторов , почему аутсорсинг за бугром ?

сама удивляюсь к счастью, сейчас это уже далеко не единственный выход.

маш - все секретничаешь

чой-то я секретничаю? Мой принцип: спрашивайте - отвечаем.

не буду спрашивать -
в Россию мне далеко посылать образцы

А, ну бывает. Олежеку из Японии вот близко оказалось

главное если билет на ераплан японцы оплатили
тогда согласен

нам действительно оказалось 7000 км до Москвы ближе всего и, главное, эффективнее всего.

Олежек - очередного таракана на Марс готовиш ?
почему в москве - самое еффективное ?
http://www.gatc-biotech.com/en/index.html
http://www.starseq.com/

у тебя под боком китайцы с 140 Хисеками

http://www.genomics.cn/en/index

http://www.genomics.cn/en/navigation/show_...gation?nid=4178

Cпасибо за мега-совет. Сразу вспомнилась заявка на грант, которая пришла ко мне на рецензию.

Граждане хотели 500 тысяч баксов с примерно таким обоснованием "работы будут проводится в сотрудничестве с ведущим институтом в области сиквенирования - BGI", потом на пару листов описание насколько крут BGI и как важно партнерство с ним. И в конце в финансовой смете "300 000 баксов идут на -- оплату работ "партнера" --- . Такое вот "партнерство".

кратко - но подробно

http://techonomy.com/2012/12/genomics-x-pr...ing-technology/

полонатор вроде приказал долго жить вместе с черчем

http://image-sensors-world.blogspot.ru/201...sed-genome.html

генсек - оставь надежду ,
ионы-протоны не победят иллумину

http://www.genomeweb.com/sequencing/rothbe...man-genome-2013



уже конец второго года , а 400 нт - в мечтах

http://resource.lifetechnologies.com/pages...Seq%20Exome.pdf