Полная версия страницы  English  

Технологии секвенирования следующего поколения.

Pages: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24
genseq, 08.06.2017 11:28
Первые поставки пошли через СкайДжин, но они не являются эксклюзивными представителями Oxford Nanopore, а желающих заработать на продаже нанопоровых секвенаторов немало. jump.gif

Стартовый кит MinION (Basic) стоит $1000:
https://store.nanoporetech.com/minion/sets/?___SID=U
Если наценка восьмикратная ($8000), то это многовато. Двукратную вряд ли найдёте из-за "заморочек" с холодовой цепью, но на трёхкратную вполне можно рассчитывать. Так что соберите несколько коммерческих предложений и выберите на свой вкус. Если самой лень, то обращайтесь в личку. Из любопытства сейчас позвонил в одну из компаний и запросил коммерческое предложение. Не сегодня-завтра обещали прислать. shuffle.gif
NMR-guy, 08.06.2017 18:29
Выложите ПОЖАЛУЙСТА первые батчи сырых данных этого прибора в архивах в текстовом формате. ОЧЕНЬ настоятельно прошу.
genseq, 10.06.2017 09:44
(NMR-guy @ 08.06.2017 16:29)
Ссылка на исходное сообщение  Выложите ПОЖАЛУЙСТА первые батчи сырых данных этого прибора в архивах в текстовом формате. ОЧЕНЬ настоятельно прошу.


http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERR1898537
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5426553/


Файл/ы:

скачать файл Long_2017.pdf
размер: 3.79
кол-во скачиваний: 221


vak, 30.06.2017 11:56
Народ, повангуйте, когда появится некий "23andme++" или там "23andme NextGen".

(23andme стартовал так задорно, но я разочарован нынешним положением дел спустя 5 лет)

Вообще, ИМХО, нужно было изначально разделять сервисы на две важные составляющие:

1. качественное секвенирование -- деливерить данные и не заниматься в рамках этой компании ничем больше, чтобы не воевать со всякими FDA и прочими мафиями

2. качественный анализ на основе данных, залитых заказчиком

причем анализ делать в странах без е**нутых законов и воинствующих клериканских настроений -- например, в этих ваших скандинавиях, в новых зеландиях, австралиях, даниях, нидерландах и даже прочих уругваях, где рейтинги свобод просто зашкаливают.
kblag, 30.06.2017 14:06
2. качественный анализ на основе данных, залитых заказчиком

причем анализ делать в странах без е**нутых законов и воинствующих клериканских настроений -- например, в этих ваших скандинавиях, в новых зеландиях, австралиях, даниях, нидерландах и даже прочих уругваях, где рейтинги свобод просто зашкаливают.


то есть Вы считаете это нормально, если человек прочитает, что у него предрасположенность к раку и покончит жизнь самоубийством?
vak, 30.06.2017 14:23
(kblag @ 30.06.2017 12:06)
Ссылка на исходное сообщение  то есть Вы считаете это нормально, если человек прочитает, что у него предрасположенность к раку и покончит жизнь самоубийством?

а вы считаете нормальным, что психически неустойчивые должны определять, к чему иметь доступ психически устойчивым? confused.gif

а что быть с этим, тоже закрыть?
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D1%80%...%83%D0%BE%D0%BB

а ножи домохозяйкам тоже больше не продавать, потому что у некоторых психически неустойчивых бывают плохие настроения?

Повесьте при входе в сервис жирную объяву, что все результаты являются вероятностными и носят лишь экспериментальный характер, что псих неустойчивым этим сервисом пользоваться КАТЕГОРИЧЕСКИ не рекоммендуется. И что на PubMed'e невероятно высокая квота ошибочных посылов.

Вообще, зачем эти полумеры, лучше запретить все буквы, а то ведь можно что-нибудь такое прочитать, от чего застрелиться захочется, я вам больше того скажу -- уже было и было не одну тысячу раз. Так что, будем последовательны и запретим буквы? shuffle.gif

из-за людей, люто защищающих свои неврозы, остальных делают обслуживателями этих самых неврозов -- huge dislike. wall.gif

P.S. я не буду в этой ветке оффтопить и обсуждать классический патерналистский бред этого типа. можно открыть эту тошнотворную тему отдельно wink.gif
genseq, 21.07.2017 15:12
7 Jul 2017, publ: 17 Jul 2017
A world of opportunities with nanopore sequencing / Richard M. Leggett , Matthew D. Clar

Рекомендую:
https://peerj.com/preprints/3090.pdf
sceptique, 21.07.2017 20:32
Если хотя бы половина из Вами прикрепленного файла - правда, то весьма скоро, лет через 5-10, большая часть генетических лабораторий будут не нужны. Как сейчас никому не нужны печатные машинки.

И секвенировать проблему будут прямо на месте ее встречи все, кому продадут эти приборчики. А зная китайцев, думаю, "британские ученые" в этой области недолго будут монополистами.
RYM, 02.08.2017 07:44
Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

https://geektimes.ru/post/291613/
genseq, 02.08.2017 18:49
(RYM @ 02.08.2017 05:44)
Ссылка на исходное сообщение  Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

https://geektimes.ru/post/291613/


Немного о предыстории этого проекта:
https://yadi.sk/i/EB3Il4HzkTniz
-Ъ-, 02.08.2017 19:24
(RYM @ 02.08.2017 08:44)
Ссылка на исходное сообщение  Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

Полностью согласен с мнением одного из участников обсуждения, на все 100%:

Проделанная автором работа впечатляет и заслуживает всяческих похвал. Однако, как это зачастую бывает с работами талантливых инженеров, практический «выхлоп» от этого ре-инжиниринга пока невелик.
Использование, и даже многоразовое использование фирменных картриджей, на руку их производителю. С ходу назову две причины:

1. Как и производители мешков для пылесосов, картриджей для принтеров и Неспрессо-кофе и т.п., даже несанкционированное повторное использование оригинальных картриджей «льёт воду на колесо» продаж производителя. Пускай даже обладатель самодельного анализатора и не купит сам прибор, но при активной работе сколько-то картриджей он всё-равно потребит. Опять же, это косвенный промоушен определённого бренда в пику другим производителям аналогичных товаров и услуг.

2. Потребитель картриджей «сидит на крючке» производителя и не представляет для него ни конкуренции ни угрозы. Так, в своё время, Стив Балмер из Майкрософта публично благодарил пиратов за распространение их ОС, потому как вторую другую ОС на тот же компьютер, за редким исключением, никто не устанавливал. Так и с картриджами. Собственно, с их продаж производители и расчитывают получать главную прибыль. Копируя что-то можно только всё время догонять оригинального производителя, но никогда его не превзойти. Собственно говоря, ре-инжиниринг ценен именно тем, что даёт понимание как сделать по-другому и лучше.

Как бы в такой ситуации действовал Западный предприниматель?
1. Изучил оригинальный патент,
2. сравнил его с результатами ре-инжиниринга,
3. разработал альтернативу «в обход» патента,
4. запатентовал свою разработку,
5. наладил производство с качеством не хуже и по меньшей цене,
6. начал вовсю использовать свой продукт сам, и уже затем
7. предложил пользователям оригинального продукта. Только на этом этапе оригинальный производитель может «увидеть» конкурента. Тут и потребуются «мускулы» стоящей за спиной юридическо-бюрократической системы для защиты интеллектуальной собственности.

Конечно, это не под силу одному, даже очень талантливому человеку. Для этого существуют Инновационные Инкубаторы и т.п. За ними стоят или государство, или большие деньги, или и то и другое. За примерами далеко ходить не нужно имея под боком опыт технологического взлёта Китая. Опять же, существует немало российских хай-тек фирм, разработки которых успешно реализуются Западными корпорациями по вышеописанной схеме.

На этом остается завершить пост и пожелать автору Здоровья и Удачи!

Там еще Kriminalist правильные вещи излагает.


От себя два слова - из пустого в порожнее... no.gif,и вечные догонялки. frown.gif

Генсек, пора делами более космическими заняться. smile.gif

Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.
sceptique, 02.08.2017 20:06
Полностью согласен с Ъ.

Так напрягаться, даже до развода, чтобы родить никому не нужную альтернативу, которая никогда не пройдёт ни лицензирований, ни регистраций, и которой нужны грязные б/ушные проприетарные чипы устаревших поколений этих пылесосов по заоблачным ценам - сразу фтопку.

Я, начиная читать, подумал что аффтар в итоге отправит готовые шаблоны чипов в Зеленоград и ждет установочную партию для проверки в своей стендовой модели, но ошибся. Он ждёт электровентиль и мечтает о рынке моечных машин для нелицензионной и преследуемой законом о защите патентов в любой стране кроме китая рекуперации проприетарных чипов.

Лучше бы поступил на ФизТех или в Бауманский и воспроизвел поровый секвенатор. Это, в отличие от помоечных (в буквальном смысле) чипов прошлой эпохи секвенирования, вполне может быть его уровень. Если угадает с длиной линкера при белковом инжиниринге поры в мембранах. А также с АЦП егойного USB-шного патч-клямпа.
guest: ASDF , 04.08.2017 08:57
Ъ, вы кажется не совсем понимаете суть ключевого здесь термина DIY )))
-Ъ-, 04.08.2017 10:24
Вы такую конкретику шарахнули, а я и не понимаю о чем речь.
О каком термине DIY идет речь, где это было?
sceptique, 04.08.2017 10:32
Пан ASDF шутит. Намекая что в случае описанного "гения"-реконструктора важнее был не результат, а сам процесс. Чем бы дитя не тешилось, типа.
-Ъ-, 07.08.2017 14:35
(guest: ASDF @ 04.08.2017 09:57)
Ссылка на исходное сообщение  Ъ, вы кажется не совсем понимаете суть ключевого здесь термина DIY )))

К моему стыду, я вообще не знал о существования этого термина.
Сегодня, случайно наткнулся на него...
Век живи, век учись, а дураком помрёшь. no.gif
guest: ASDF , 10.08.2017 20:33
(sceptique @ 04.08.2017 10:32)
Ссылка на исходное сообщение  Пан ASDF шутит. Намекая что в случае описанного "гения"-реконструктора важнее был  не результат, а сам процесс. Чем бы дитя не тешилось, типа.

Да почему шучу то? DIY - своя вселенная, пересекается с биохакингом, и вообще ...))). У них даже конференции свой проводяться, так что все серьезно.
genseq, 31.08.2017 19:20
Кстати, о DIY-секвенаторе. Недавно появился посвящённый его разработке сайт:
http://sokolov.expert/
Там уже и старенький ДНК-синтезатор разобрали.
kb1, 01.09.2017 14:24
(genseq @ 31.08.2017 20:20)
Ссылка на исходное сообщение  Кстати, о DIY-секвенаторе. Недавно появился посвящённый его разработке сайт:
http://sokolov.expert/
Там уже и старенький ДНК-синтезатор разобрали.


А старенький запорожец ре-инженирить они не пытались? smile.gif Это встретило бы куда больший отклик на просторах Рунета

С одной стороны, стремление познать устройство вещей весьма похвально, и возможность многократно использовать одноразовые чипы для кого-то может быть полезным (помню как на заре своей трудовой деятельности мыл носики и эппендорфы), но "разрабатывать" что-либо где ключевой элемент это б/у расходники из помойного ведра... Конечно, каждый волен направлять свои усилия на достижения собственных целей, но зачем же гордо заявлять, что мы на пороге создания, хоть и скопированного, но своего секвенатора. А ну как чипы на помойке закончатся? Что делать будем?
КапризныйПрофессор, 05.09.2017 01:50
Секвенирование ДНК в домашних условиях
https://geektimes.ru/post/291613/
genseq, 05.09.2017 08:59
https://yadi.sk/i/EB3Il4HzkTniz
-Ъ-, 05.09.2017 11:50
Спрашивается на фига тему клонировать. Про этого Соколова уже обсуждали:
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=484510&st=950
А это из обсуждения (на мой взгляд самый меткий отзыв):

Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

Ъ полностью согласен с мнением одного из участников обсуждения, на все 100%:

Проделанная автором работа впечатляет и заслуживает всяческих похвал. Однако, как это зачастую бывает с работами талантливых инженеров, практический «выхлоп» от этого ре-инжиниринга пока невелик.
Использование, и даже многоразовое использование фирменных картриджей, на руку их производителю. С ходу назову две причины:

1. Как и производители мешков для пылесосов, картриджей для принтеров и Неспрессо-кофе и т.п., даже несанкционированное повторное использование оригинальных картриджей «льёт воду на колесо» продаж производителя. Пускай даже обладатель самодельного анализатора и не купит сам прибор, но при активной работе сколько-то картриджей он всё-равно потребит. Опять же, это косвенный промоушен определённого бренда в пику другим производителям аналогичных товаров и услуг.

2. Потребитель картриджей «сидит на крючке» производителя и не представляет для него ни конкуренции ни угрозы. Так, в своё время, Стив Балмер из Майкрософта публично благодарил пиратов за распространение их ОС, потому как вторую другую ОС на тот же компьютер, за редким исключением, никто не устанавливал. Так и с картриджами. Собственно, с их продаж производители и расчитывают получать главную прибыль. Копируя что-то можно только всё время догонять оригинального производителя, но никогда его не превзойти. Собственно говоря, ре-инжиниринг ценен именно тем, что даёт понимание как сделать по-другому и лучше.

Как бы в такой ситуации действовал Западный предприниматель?
1. Изучил оригинальный патент,
2. сравнил его с результатами ре-инжиниринга,
3. разработал альтернативу «в обход» патента,
4. запатентовал свою разработку,
5. наладил производство с качеством не хуже и по меньшей цене,
6. начал вовсю использовать свой продукт сам, и уже затем
7. предложил пользователям оригинального продукта. Только на этом этапе оригинальный производитель может «увидеть» конкурента. Тут и потребуются «мускулы» стоящей за спиной юридическо-бюрократической системы для защиты интеллектуальной собственности.

Конечно, это не под силу одному, даже очень талантливому человеку. Для этого существуют Инновационные Инкубаторы и т.п. За ними стоят или государство, или большие деньги, или и то и другое. За примерами далеко ходить не нужно имея под боком опыт технологического взлёта Китая. Опять же, существует немало российских хай-тек фирм, разработки которых успешно реализуются Западными корпорациями по вышеописанной схеме.

На этом остается завершить пост и пожелать автору Здоровья и Удачи!

Там еще Kriminalist правильные вещи излагает.


От себя два слова - из пустого в порожнее... no.gif,и вечные догонялки. frown.gif

Генсек, пора делами более космическими заняться. smile.gif

Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.

Сообщение было отредактировано -Ъ- - 02.08.2017 20:26
R-J-Dio, 05.09.2017 12:24
по пункту 5 или 6. Он не наступает, тк. после п.5 идет продажа компании большому игроку, а
бабло тратится на создание чего-то нового, как правило, намного менее успешного, ибо на долю человека (за искл. гениев) приходится один хит за жизнь
kblag, 05.09.2017 14:03
Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.

надеюсь это комплемент smile.gif
-Ъ-, 05.09.2017 14:51
(kblag @ 05.09.2017 15:03)
Ссылка на исходное сообщение  надеюсь это комплемент smile.gif

Не фига, зайдите на Комментарии и найдете себя.
kablag, если "ошибился" - пардон.
kblag, 05.09.2017 15:10
да я в курсе, что писал там. А что конкретно вызвало Ваше недовольство?
genseq, 10.09.2017 12:07
https://leader-id.ru/event/4902/
21 сентября в Агентстве стратегических исследований (г. Москва, Малый Конюшковский переулок, д. 2) состоится "стретегическая сессия" на тему «Технологии секвенирования следующего поколения в России – что нам делать своего?»

Первоочередной вопрос:
"Нужно ли разрабатывать в России собственные технологии секвенирования следующего поколения ...?"
sceptique, 10.09.2017 14:03
Скажите там всем, что кроме порового секвенирования через 5-10 лет в мире ничего не останется.

Пусть заказывают не лажу, которую уже направляют на помойку на Западе (то есть - в наши взяткооткаточные круги), а поровые секвенаторы. На вопрос "что нам делать своего?" - прямой ответ: поровые секвенаторы. И делать должны не дедушки с именами и альцгеймерами (и тяжелым алкоголизмом в терминальной стадии) и не их горе-потомки, а реально самые свежие и опытные группы на текущий момент времени. Иначе дедушки опять всё попилят, а их потомки начнут ныть что у них ничего нет для клиники давайте отдадим все деньги зарубежным корпорациям, на службе которых они состоят.
genseq, 10.09.2017 14:44
Меня там, скорее всего, не будет. Так что скажите всё сами. У них, если не ошибаюсь, участие возможно и в режиме веб-конференции.
Neo 777, 10.09.2017 18:38
Ответ, наверное, простой:
помимо всего "заказанного", мы должны уметь производить все свое - методики, секвенаторы, расходники и т.п. - качеством не хуже зарубежных. Головы у нас хорошие, была бы задача четко поставлена. Лучше - Кремлем.
Хотя, судя по качеству наших отечественных автомобилей и отсутствия на рынке адекватных моделей ноутов и сотовых телефонов, - далеко нам еще до отечественных секвенаторов и технологической независимости...
MMM, 10.09.2017 20:28
Кроме голов там нужны элементарные деньги и просто квалифицированные кадры для создания того, что называется отраслевой инфраструктурой.
genseq, 14.09.2017 19:32
В США тратят на проект PMI (секвенирование миллиона американцев) больше 300 млн.$ в год. umnik.gif
Сколько миллионов (или миллиардов) рублей в год нужно тратить в России, чтобы догнать и перегнать Америку? confused.gif
avial, 14.09.2017 21:19
Как уже здесь писали - нет инфраструктуры. Один из ключевых элементов американской программы - использование слинкованных с частью геномных данных электронных медицинских карт. Уже пошли публикации с анализом 50 тысяч электронных карт с экзомами.
А у нас 60 геномов сделали в рамках Геномов России. Великое дело. Целых 32 экзома раковых вот недавно с постером на ЕСМО ездили (результаты РНФ, между прочим). Еще пару десятков экзомов уже третий год по российским конференциям с одним докладом катаются. Дальше продолжать?)

Причем все сделать можно, не сразу, не завтра, но можно. Подняв заодно пару соседних отраслей - от медицины до бигдата-аналитики. Но только это тяжело, нудно и в жизнь чиновника может не поместиться. Поэтому лучше 60 геномов - так безопаснее. А деньги здесь уже неважны.
sceptique, 17.09.2017 02:36
Авиал, я Вас немного ещё дальше расстрою: на мой взгляд, у нас в медицинских картах такое пишется и иногда в таких целях, даже в электронных картах, что это даже хорошо, что пока к ним ничего не пытаются линковать. lol.gif Будет еще хуже, чем сейчас, если миллион карт таким образом косвенно проверят генетикой и куда-то захотят подшить. lol.gif

Если такое кто сделает - слетит много дегенерировавших за 80-90 лет жизни голов. Которые сейчас на месте лишь по причине дружеской фальсификации статистики. А если часть маркеров будут высокозначимыми (OR 3-5 и выше), а в наших историях всплывёт вся кривая по политическим мотивам диагностика на их фоне - это ж как пилить сук на котором сидишь. Понятно, что больше 20-100 геномов, по десятку на патологию lol.gif, обычно - поставленную самими авторами исследований в своих отделениях, никто никому расследовать не даст. Во избежание, так сказать.
genseq, 17.09.2017 09:53
По данным Минздрава в 2016 году количество новых случаев ВИЧ-инфекции уменьшилось на 6,3%. По данным Роспотребнадзора это количество увеличилось на 5,3% (до 103,5 тысяч случаев). А за всё время наблюдения в России к началу 2017 года зарегистрировано 1114 тыс. носителей ВИЧ. Правда, с учётом умерших (243 тыс.) эта цифра будет меньше.

Расхождения связаны с тем, что Роспотребнадзор учитывает все положительные пробы, а Минздрав в этом году начал считать количество пациентов, вставших на учёт в антиспидовских центрах.

До недавних пор официальными считались данные Роспостребнадзора, но ни у кого не вызывает сомнений (кроме сомневающихся), что данные Минздрава по новым случаям более объективны. Да и умерших носителей ВИЧ пересчитывать нет смысла. Отсюда следует, что в начале следующего года официальными будут считаться данные Минздрава. И к выборам президента эпидемия ВИЧ пойдёт на убыль.

А при чём здесь секвенирование? Да ни при чём. Просто навеяло. shuffle.gif
sceptique, 17.09.2017 22:34
Дался вам этот спид, с ним вопрос уже закрыт давно.
genseq, 18.09.2017 08:21
Вопрос ещё только открывается. Тем более, что количество ВААРТ-резистентных вариантов ВИЧ быстро растёт, и определять эти варианты лучше всего при помощи NGS.

Эпидемия ежегодно даёт больше 100 тысяч клиентов, готовых платить за секвенирование ВИЧ. И скоро их будет ещё больше. что может служить неплохим стимулом для развития NGS в России.

Цинично, конечно, наживаться на смертельно больных людях, но лучше так, чем никак.
sceptique, 18.09.2017 10:42
Накой его секвенировать, если к каждому новому резистенту все равно не успеют сварить лекарство? Если бы у меня нашли ВИЧ, я бы не стал особо разбрасываться деньгами и имуществом - смысла нету никакого, и это в какой-то мере даже хорошо, в смысле есть определенность что точно через несколько месяцев-лет подохнешь от пневмонии или саркомы.
Neo 777, 19.09.2017 01:20
Скажу только одно, господа-товарищи.
В России много сейчас развалено. Наука тоже развалена. Все выживают, как могут в их гребаном азпромовском капитализме.
В науке и медицине МОЖНО решить много интересных кардинальных проблем, если заняться этим всем вместе, слаженно, скоординровано, с энтузиазмом, при полной поддержке государства.
Но ни наука, ни ученые нашему государству нахер, я извиняюсь, не нужны. Везде только БАБЛО на первом месте. Да еще мы собачимся друг с другом. Горько. Позор.
genseq, 19.09.2017 09:49
Наука интернациональна. То, что вклад России в неё заметно уменьшился - это, конечно, обидно. Но причиной являются не столько нищенские зарплаты российских научных работников, сколько нехватка у них мозгов. Наиболее сообразительные сбежали за бугор, а оставшихся, как правило, интересует не столько наука, сколько возможность заработать на ней деньги. И если наука в России всё ещё жива, то это благодаря чудакам, которые, несмотря на наличие мозгов, не сбежали. И не стали молиться золотому тельцу.

Но вернёмся к нашим баранам.
Насколько мне известно, сейчас в России имеется два NovaSeq 6000 - в НИЦ "Курчатовский институт" и в ООО "ЦГРМ "ГЕНЕТИКО".
Может быть, есть и другие?

И ещё:
сколько сейчас в России нанопоровых секвенаторов MinION?

Хотелось бы украсить завтрашний доклад свежей информацией.
sceptique, 21.09.2017 18:53
Можно из этой презентации брать слайды для своих докладов с измененной темой оформления и указания на Вас как на источник?
genseq, 21.09.2017 19:00
Естественно. smile.gif
avial, 21.09.2017 21:58
Генсек, не удалось попасть на сегодняшнее сборище, но присутствющие передавали респект за доклад)
genseq, 22.09.2017 19:16
Спасибо за респект. И буду признателен за любые замечания, дополнения и предложения. Постараюсь их учесть в докладе на ВДНХ (зал №1, 13 октября, 11.00-13.00 Секция «Медицина 5 «П»: настоящее и будущее»):
http://congress.fedlab.ru/

И ещё немного о секвенировании:

скачать файл ______________4.pdf
размер: 93.54
кол-во скачиваний: 231



Замечания и дополнения также приветствуются.
Carbon Copy, 22.09.2017 20:32
(genseq @ 22.09.2017 17:16)
Ссылка на исходное сообщение  Спасибо за респект. И буду признателен за любые замечания, дополнения и предложения. Постараюсь их учесть в докладе на ВДНХ (зал №1, 13 октября, 11.00-13.00 Секция «Медицина 5 «П»: настоящее и будущее»):
http://congress.fedlab.ru/

И ещё немного о секвенировании:

скачать файл ______________4.pdf
размер: 93.54
кол-во скачиваний: 231



Замечания и дополнения также приветствуются.

Маниловщина и wishful thinking. Хоть бы один обычный ди-деокси секвенатор или нормальный реал-таим ПЦР циклер построили и олиги по-нормальному синтезировать и метить научились, а уж потом о постройке некстген секвенатора задумывались. Хотя для попила бюджета любой отмаз хорош.
sceptique, 22.09.2017 23:17
Поровым секвенаторам меченые олиги не нужны. Нужна хорошая электроника, по типу как у патч-клямп-микроэлектродного усилителя на каждой ячейке. А с этим у нас вполне могут справиться.

Обычные олиги - уже давно научились.

Можете сколько угодно доказывать преимущества прецизионного клонирования без метионина на конце и какие все у нас безрукие и неспособные (это правда только про завлабов и академиков). А все уже будут через лет 5 секвенировать геномы, экзомы и микробиомы в приборах размерами с лазерный принтер и Вам глубоко сочувствовать.
sceptique, 22.09.2017 23:46
(genseq @ 22.09.2017 20:16)
Ссылка на исходное сообщение  Спасибо за респект. И буду признателен за любые замечания, дополнения и предложения. Постараюсь их учесть в докладе на ВДНХ (зал №1, 13 октября, 11.00-13.00 Секция «Медицина 5 «П»: настоящее и будущее»):
http://congress.fedlab.ru/

И ещё немного о секвенировании:

скачать файл ______________4.pdf
размер: 93.54
кол-во скачиваний: 231



Замечания и дополнения также приветствуются.

Замечание всего одно: завхозам и всяким дегенерировавшим академикам выгодно необратимое отставание РФ в области секвенаторостроения. Поскольку откаты с американского старья и софта лучше и безопаснее оставлять в оффшорах, чем напрягаться и нервничать чего-то разрабатывая с риском не справиться у себя дома. Нашим местным деятелям на самом верху кормовой цепочки экономически невыгоден наш же местный прогресс в этой области. Жить рантье на проценты с оффшоров после отползания за срок давности по всяким коррупционным расследованиям - это их вполне устраивает. А возня и риски в конструировании своих нанопоровых секвенаторов - нет... frown.gif
-Ъ-, 25.09.2017 11:13
sceptique, одобрям! smile.gif, Вы правы, цветочки от меня. Но где выход то из метро!? eek.gif
А ведь Карбоныч прав на 100%. frown.gif

Генсек, охота тебе ликбезом заниматься. no.gif Способствуешь процветанию мракобесия чинуш в области "секвенаторостроения", вводишь в заблуждение неокрепшие умы, пардон.
А теперь что будем делать с порами, сужать или расширять? wink.gif
Слава богу не поддался твоему вредному влиянию лет 10 или 15 назад.
sceptique, 25.09.2017 11:33
Поры нужны только с моноканальным усилителем класса "патчклямп" с наносекундной постоянной времени усиления или оцифровки сигнала. Тут дело не в одной поре, а в комбинации работы максимального отношения сигнала к шуму, минимальной постоянной времени измерения и поры, которая протягивает через себя всё не слишком быстро, но и не слишком медленно, чтобы можно было измерять и назначать сигнал за время прохождения поры ровно одним нуклеотидомЪ wink.gif

Пилить госбюджет и выводить его себе на Кипр и в ЛюксембургЪ - всяко проще. Сейчас, кстати, разворачивается нешуточная борьба за пост конкурсного банкротного управляющего РАН, который следующие 5 лет будет иметь верховное право распродавать ее активы. Вы за кого болеете в этом ВысокомЪ Соревновании?

Выход из метро, дорогой неошибающийся -Ъ-, в том, чтобы не быть маньяком и не вовлекаться в то, что и так создано чтобы развалиться и погребсти под развалинами всех, кто живёт ради не совсем правильных вещей.
-Ъ-, 25.09.2017 11:53
(sceptique @ 25.09.2017 12:33)
Ссылка на исходное сообщение  
Пилить госбюджет и выводить его себе на Кипр и в ЛюксембургЪ - всяко проще. Сейчас, кстати, разворачивается нешуточная борьба за пост конкурсного банкротного управляющего РАН, который следующие 5 лет будет иметь верховное право распродавать ее активы. Вы за кого болеете в этом ВысокомЪ Соревновании?

Я вне РАН давно и голосовать мне не придется. Ну если только позовут. wink.gif
А ведь я тоже люблю на Кипре отдыхать, регулярно. shuffle.gif
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.