Добрый день! Возникла проблема с секвенированием участка ITS1 у трематоды A. conchicola. Секвенатор считывает первые 250 пар и после (TG)-повторов (10-12) сигнал резко падает, после чего чтение невозможно. Подскажите, в чем может быть причина и как это исправить, не прибегая к клонированию. Реакцию ставлю с 1 мкл BigDye 3.1 в 10 мкл смеси, программа - по протоколу.
Спасибо.

вот как раз без клонирования не получится. сталкивался сам с такой проблемой. бетаин, дмсо и проие присадки не срабатывают. а с плазмиды с первого раза все читается. вобщем мой опыт таков что можно долго играть с добавками но проше и быстрее и надежнее клонировать