Люди прошу помощи

Я могу увидеть как то на уровне молекул эти гены ? То есть могу ли я где то найти PDB детально всех нуклеотидов чтобы загнать потом в Gaussian и HyperChem ?

Я вот здесь полазил:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?d...oGeneMainReport

http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp....rezgene&id=3305

но что то не могу найти... (раньше такого не делал)

и если можно сразу подскажите где в этих базах можно найти список опубликованных статей по структуре этих генов...


Спасибо

http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

если здесь и в пабмеде нет, то значит вообще нет.

для того, чтобы "найти PDB детально всех нуклеотидов" мало быть генетиком, к сожалению, нужно, чтобы эти молекулы экспрессировались в e-coli, были стабильны или давали кристалллы. +пару-тройку лямов денег и 3-5 лет работы лаборатории средних размеров.

Нет, эксспериментально это не проверяли, и смоделировать тоже невозможно, но, скорее всего, Вам это и не нужно. Напишите, какая задача перед Вами стоит, может быть что-то придумаем.

Спасибо ув. Nastja. Четко сформулирую с подбором материала (нужно время) и напишу Вам

Структуру ДНК с нужной вам последовательностью можно создать, например, с помощью http://haddock.science.uu.nl/dna/dna.php
Но там ДНК будет в виде идеальной B-формы. Для примерного предсказания структуры со всеми изгибами был ещё сервис, описанный в этой статье: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18467772 (интернет-адрес самого сервиса не помню, надо искать). Если умеете писать скрипты, лучше всего воспользоваться программой X3DNA, с теми структурными параметрами, какие вам больше нравятся. Я, правда, делал структуры не больше 300 нуклеотидов.

Подскажите, какие среди этих баз List of biological databases

содержат инфу именно о структуре ?

то что вот этот раздел:



это понятно. А кроме этого раздела там еще есть что то по структуре (в частности участков ДНК) ?

Нет.

Saxon Mullins 123VEGA says she once had PRAGMATIC PLAY romantic dreams of what her 'first time' would ICONIC GAMING be like. In none was หวยปิงปอง she paralysed by fear in a Sydney ปั่นสล็อต alleyway, aged 18, with a 123GOAL man she had met only minutes earlier. Ms 88KTC Mullins has always maintained FC SLOT this incident - in 2013 - was rape. It spurred AMB CASINO her to push for legal 11HILO reform in Australia, after a long court battle ended with a judge finding the man involved did not realise she hadn't consented to sex.