Мне нужно проанализировать данные реал тайм пцр(СТ), для этого я хочу сделать ттест который интегрирован в эксель, у меня проблема в выборе типа ттеста (1,2,3), и количества выборки, (1 или 2)
данные у меня в трипликатах, сравниваю два образца, с добавлением и без добавления препарата. все нормализировано под хаускипинг ген
1-непарный
2 парный с одинаковым вариансом
3 парный с разным

собственно мне предлагаю выбрать 1 в плане количества выборки, и тип 3 с парным разным страндартным отклонением. Но в разных источниках написано по разному и я запуталась, где то говорят выбрать непарные тест и 2 выборки.
Помогите пожалуйста кто в этом разбирается

Спасибо

Действительно запутались. Не существует парных критериев с одинаковыми и разными дисперсиями. Парный только один. Существуют варианты критерия для независимых выборок:
(1) с неизвестными, но равными дисперсиями (классический критерий Стьюдента),
(2) с неизвестными и неравными дисперсиями (подход Вэлча).
Если один образец вы целиком тратите на анализ без препарата, а какой-то другой образец анализируете после только после введения препарата - у вас независимые выборки.
Если в ходе эксперимента вы берёте один и тот же образец, делите его на 2 части и к одной добавляете препарат, а затем анализируете обе эти части - у вас зависимые выборки. Скорее всего у вас именно такой вариант. Следовательно данные можно анализировать парным t-критерием (если распределение разности пар примерно нормальное) или его непараметрическим аналогом - критерием Уилкоксона для разностей пар (Wilcoxon Matched-Pairs Signed Ranks Test).

У меня данные в технических трипликатах для гена из одного образца, до и после препарата. Можно ли вообще ттест тут использовать? Я поняла что он у меня парный с неравными дисперсиями. Еще вопрос по tails, two tails ili 1 tail.
как я поняла 1 тейл-это когда я знаю в какую сторону у меня сдвиг
2 тейл когда сдвиг может быть в обе стороны (это я неграмотным языком выражаюсь).
так вот какой в этом случае выбрать.
данные :

ген Х
полученые данные в трипликатах

образец-препарат а б с
образец+препарат а б с


дальше идеть нормализация по хаускипинг гену

Стоит ли в этом случае делать ттест и выводить значение р

Несметно благодарю (простите за математическую неграмотность)

По моему план эксперимента у Вас более сложный. Брать среднее трех опытов в серии и "совать" его в парный тест как то в наш век "когда балет бороздит просторы космоса" не инновационно


Почитав про модели описывающие анализы с повторными измерениями вот отсюда

http://lme4.r-forge.r-project.org/lMMwR/ (в Rnw файлах исходные тексты как что считал Автор можно подсмотреть)

http://lme4.r-forge.r-project.org/lMMwR/lrgprt.pdf

можно прийти к выводу что терять добытую экспериментом дисперсию за так просто не принято .

в эксперименте по каждому опыту есть --- факторы: 1) образец, 2) препарат и 3) номер в трипликате (раз уж они именованы наверное они шли по порядку как миниумум) ну и в 4) записан результат чего при данном сочетании факторов меряли.

"препарат" вложен в "образец", "номер в трипликате" может быть вложен в образец, но логичнее фактор "образец" представить вложенным в "номер в трипликате" (получается как бы трипликат это фактор --- "серия опытов").

Вот эту модель со смешанными эффектами и подгонять.

Ну это вы уважаемый уже и в Ар залезли, спасибо, но мне это просто не осилить, вопрос был просто можно ли использовать ттест с техническими репликатами? Если да то прекрасно, если нет то почему.

Все ясно как божий день, ттест для анализа экспрессии генов можно делать только с биологическими репликатами и нормализованными показателями. То есть технические репликаты делаются только для удостоверения условий реакций итд. Биологические репликаты должны исходить от разных образцов (нр мышей) при тех же условиях.
эх значит не получится у меня попонтоватсься с р значением.

Saxon Mullins 123VEGA says she once had PRAGMATIC PLAY romantic dreams of what her 'first time' would ICONIC GAMING be like. In none was หวยปิงปอง she paralysed by fear in a Sydney ปั่นสล็อต alleyway, aged 18, with a 123GOAL man she had met only minutes earlier. Ms 88KTC Mullins has always maintained FC SLOT this incident - in 2013 - was rape. It spurred AMB CASINO her to push for legal 11HILO reform in Australia, after a long court battle ended with a judge finding the man involved did not realise she hadn't consented to sex.