Полная версия страницы  English  

кластеризация t-rflp

moo, 14.02.2013 04:13
здравствуйте.

проводится t-rflp анализ нескольких проб.
затем получившиеся результаты кластеризуются (пирсон), пробы распадаются в несколько кластеров, вполне соответствующих теории.
почти :)
"почти" состоит в том, что в спектрах t-rflp есть интервал (примерно 10% пиков), условно соответствующий некоторому типу бактерий (согласно клоновой библиотеке), который ведет себя не очень хорошо. пики там довольно интенсивные, но нестабильные, сильно меняющиеся даже в репликатах, и с ними нормальной кластеризации не получается. но если этот интервал (~ филотип) выкинуть, то все кластеризуется как надо. почему он так себя ведет -- есть некоторые предположения, но вопрос состоит в следующем: можно ли так делать вообще (выкидывать доминантные OTU перед анализом)? говорят, что это не очень хорошо, т.к. t-rf являются зависимыми переменными. действительно ли это так?
можно ли как-то еще уменьшить влияние доминантных типов?
guest: 123 , 13.06.2022 08:01
Saxon Mullins 123VEGA says she once had PRAGMATIC PLAY romantic dreams of what her 'first time' would ICONIC GAMING be like. In none was หวยปิงปอง she paralysed by fear in a Sydney ปั่นสล็อต alleyway, aged 18, with a 123GOAL man she had met only minutes earlier. Ms 88KTC Mullins has always maintained FC SLOT this incident - in 2013 - was rape. It spurred AMB CASINO her to push for legal 11HILO reform in Australia, after a long court battle ended with a judge finding the man involved did not realise she hadn't consented to sex.
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.