Полная версия страницы  English  

Как обогатить препарат суммарных НК

guest: Василий , 26.02.2013 11:05
Здравствуйте все!

Есть препарат суммарных нуклеиновых кислот,
есть ли способы существенно обогатить его по содержанию РНК для проведения обратной транскрипции? Обогатить ДНК проще, насколько я понимаю.
AlexRez, 26.02.2013 14:01
Что значит обогатить? Увеличить концентрацию на единицу объема?
Агроном, 26.02.2013 14:05
Взять набор для выделения РНК и обогащать до посинения)
genseq, 26.02.2013 15:26
Классический способ - по Хомчинскому:
Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction / Anal. Biochem. - 1987. – Vol.162. – P.156-159.
Пока ничего лучше не придумали.
ship, 26.02.2013 19:25
обработать ДНКазой
abdula, 26.02.2013 22:29
(guest: Василий @ 26.02.2013 12:05)
Ссылка на исходное сообщение  Здравствуйте все!

Есть препарат суммарных нуклеиновых кислот,
есть ли способы существенно обогатить его по содержанию РНК для проведения обратной транскрипции? Обогатить ДНК проще, насколько я понимаю.


рибо-зеро smile.gif
Guest, 26.02.2013 22:38
А что такое "обогатить днк"?
abdula, 26.02.2013 22:40
(guest: Василий @ 26.02.2013 12:05)
Ссылка на исходное сообщение  Здравствуйте все!

Есть препарат суммарных нуклеиновых кислот,
есть ли способы существенно обогатить его по содержанию РНК для проведения обратной транскрипции? Обогатить ДНК проще, насколько я понимаю.


ну днказой , а потом рибозеро - если рнк-сек
Ash, 27.02.2013 07:29
Добрый день!

Спасибо за советы. Ситуация такая - нуклеиновые кислоты уже выделены, поэтому вопрос - если эту смесь еще раз выделять приняться по тому же Хочинскому - РНК не поплохеет от кучи дополнительных манипуляций? Да и получится ли освободиться от уже выделенной ранее ДНК?

ДНКазой был бы идеальный вариант. но где ее взять РНКаза-фри?

...Поиграться можно, конечно, объем позволяет, но вопрос именно про возможность достаточно простыми манипуляциями снизить концентрацию ДНК, и увеличить - РНК.
guest: ммм , 27.02.2013 07:34
--ДНКазой был бы идеальный вариант. но где ее взять РНКаза-фри?

В магазине.
Агроном, 27.02.2013 08:34
РНК для проведения обратной транскрипции

а ОТ чего собираетесь делать, если не секрет?
vtosha, 27.02.2013 09:47
Киагеновские киты позволяют выделять отдельно ДНК и РНК.
-Ъ-, 27.02.2013 10:01
Васе надо всего лишь научиться выделять РНК, свободную от ДНК. frown.gif
А протоколов (и китов) на эту тему - тьма!
Как правило, с использованием ДНК-азы РНКаз-фри... Но классика рулит, ессно, в очумелых ручках. umnik.gif
Guest, 27.02.2013 10:03
(Агроном @ 27.02.2013 08:34)
Ссылка на исходное сообщение  а ОТ чего собираетесь делать, если не секрет?

Фрагменты геномов РНК-содержащих вирусов растений.
Guest, 27.02.2013 10:07
(-Ъ- @ 27.02.2013 10:01)
Ссылка на исходное сообщение  Васе надо всего лишь научиться выделять РНК, свободную от ДНК. frown.gif
А протоколов (и китов) на эту тему - тьма!
Как правило, с использованием  ДНК-азы РНКаз-фри... Но классика рулит, ессно, в очумелых ручках. umnik.gif

Ну, собственно, что касается моего опыта, по Хомчинскому выделение получается прекрасно. РНК потом хранилась натурально годами.
Но здесь обратились с советом коллеги, их аспиранту Василию перепала коллекция уже выделенных препаратов ДНК/РНК, и, собственно. вопрос в том, можно ли что-то сделать уже с имеющимся? А так, да, для выделения РНК китов и методов полно, на любой вкус...
Ash, 27.02.2013 10:09
Не вошел smile.gif Предыдущие два сообщения - мои.
-Ъ-, 27.02.2013 10:18
(Guest @ 27.02.2013 11:07)
Ссылка на исходное сообщение  Ну, собственно, что касается моего опыта, по Хомчинскому выделение получается прекрасно. РНК потом хранилась натурально годами.
Но здесь обратились с советом коллеги, их аспиранту Василию перепала коллекция уже выделенных препаратов ДНК/РНК, и, собственно. вопрос в том, можно ли что-то сделать уже с имеющимся? А так, да, для выделения РНК китов и методов полно, на любой вкус...

vtosha предлагает самый оптимальный вариант. Там используется обработка ДНК-азой прямо на мембране. Так кажется, сам никогда этими китами не пользовался.
abdula, 27.02.2013 23:05
(Ash @ 27.02.2013 08:29)
Ссылка на исходное сообщение  Добрый день!

Спасибо за советы. Ситуация такая - нуклеиновые кислоты уже выделены, поэтому вопрос - если эту смесь еще раз выделять приняться по тому же Хочинскому - РНК не поплохеет от кучи дополнительных манипуляций? Да и получится ли освободиться от уже выделенной ранее ДНК?

ДНКазой был бы идеальный вариант. но где ее взять РНКаза-фри?

...Поиграться можно, конечно, объем позволяет, но вопрос именно про возможность достаточно простыми манипуляциями снизить концентрацию ДНК, и увеличить - РНК.


а агилентовском биоаналайзере гоните свою рнка и смотрите рин - ну и увидете поплохело рнка или непоплохело smile.gif
abdula, 27.02.2013 23:07
http://gene-quantification.net/RIN.pdf
abdula, 27.02.2013 23:27
(guest: Василий @ 26.02.2013 12:05)
Ссылка на исходное сообщение  Здравствуйте все!

Есть препарат суммарных нуклеиновых кислот,
есть ли способы существенно обогатить его по содержанию РНК для проведения обратной транскрипции? Обогатить ДНК проще, насколько я понимаю.

http://seqanswers.com/forums/archive/index.php/t-20699.html
nigoal123, 27.05.2022 06:57
The first sentence has nigoal one single purpose ลิงค์รับทรัพย์ to entice the reader to sexy gaming Write in a semi-informal dream gaming read the next sentence. ka gaming rewarding to satisfy curiosity.

it sets the tone for 123goal the rest of the article 11hilo hooking the reader in 123bets choose the best three or four. pggame123 one step at a time. big gaming are intrigued by a question
guest: 123 , 02.06.2022 12:19
For years there 123VEGA have been FA CHAI SLOT calls for Asia - which JILI SLOT is home to some PRAGMATIC PLAY of the world's สล็อตPG biggest CO2 emitters - to ditch fossil fuels 11HILO to help tackle climate AMB CASINO change. Countries in the region - including FC SLOT its three biggest economies 88KTC China, Japan and India - were criticised last year 123GOAL for not making a bigger.
123goal 123goal, 10.06.2022 13:56
You need to work on yourself if 123GOAL you are lacking inner confidence. This takes 11hilo time, but the rewards are worth it. Every สล็อต 123 time you think pggame123 negatively about yourself, counter that thought big gaming with a positive one, or when you feel 123dic a negative thought coming on – list three 11 ไฮโล things that you are appreciativeslotxo of. Believe in yourself. Make it maintaining a long ambslot part of your morning routine to compliment yourself when you slotonline see your reflection in the mirror. The more confident you are, the more likely you will feel comfortable showing other people the real you!
123goal 123goal, 13.06.2022 10:29
What is the goal 123GOAL of your content? You should สล็อต 123 always be driving your audience to pggame123 a next step – whether that’s viewing another บาคาร่าออนไลน์ blog post, signing up for a newsletter, or sharing the 11 ไฮโล content. Good content is actionable เกมสล็อต because it asks the person 123dic viewing it to do something. Every big gaming piece of content you produce should provide a clear, actionablect855 next step. To make your 123bets content actionable.
Ufa1688, 15.09.2022 11:35
Three weeks after แทงบอล168 meeting Xi in Beijing and just รูเล็ต days after the Winter Olympics ดรีมเกมส์ ended, Putin launched aff 1688ด a full scale invasion of Ukraine. ufa1688 He had expected a quick victory Pragmatic Play but seven months in 1688.com Russia is far from winning. Its forces Manna Play are exhausted, demoralized Gamatron and fleeing territories they ลิงค์รับทรัพย์ have occupied for months.
Ufa1688, 15.05.2023 06:14
While the Patriot ปั่นสล็อต system has been successful เกมสล็อต in countering ballistic missiles สูตรสล็อต its ability to stop air-launched ทาง เข้า ufabet hypersonic missiles was ufabet vip purely theoretical before last week. Ukraine’s ทาง เข้า ufabet มือ ถือ intercept has now provided a real-world แฮนดิแคป คือ demonstration of that capability 123goal something that has been viewed nigoal123 within the Pentagon as a major app aff1688 development, the source
Это — лёгкая версия форума. Чтобы попасть на полную, щелкните здесь.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.